More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3158 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3158  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 251 aa  484  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.797514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30240  IclR family regulatory protein  32.77 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  30.04 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5250  IclR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 256 aa  72  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  29.58 
 
 		 264 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  25.51 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  25.51 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  25.51 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  25.51 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  30.37 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  25.51 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  25.51 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2147  IclR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  26.82 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  28.22 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  26.34 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  26.34 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  26.34 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  26.34 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  26.34 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  26.34 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  26.34 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  26.34 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0296  IclR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02910  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186754 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3124  IclR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.845824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  28.45 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4910  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2705  regulatory proteins, IclR  29.91 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  25.31 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  26.01 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  29.73 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2601  IclR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505615  normal  0.0687199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3242  IclR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524532 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  25.23 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  27.82 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4650  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.455658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  25.23 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5781  transcriptional regulator, IclR family  28.16 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  29.6 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  25.55 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  28.83 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6106  IclR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5704 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0480  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  25.55 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 260 aa  62  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  28.77 
 
 		 254 aa  62  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1642  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  24.77 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  23.74 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4817  IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  28.14 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1572  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5724  transcriptional regulator, IclR family  30.17 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1587  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  30.36 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  24.71 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1189  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1669  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  30.6 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  28.05 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  25.69 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  27.42 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  25.1 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  27.94 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  25.23 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  28.38 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  28.26 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  28.38 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  28.05 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1568  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  27.39 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  24.78 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  24.32 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  27.91 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2088  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  27.52 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  25.47 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>