152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_D6484 on replicon NC_007337
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6484  regulatory protein, IclR  100 
 
 		 259 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476341  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1527  regulatory proteins, IclR  29.03 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0315  regulatory protein, IclR  28.87 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1566  IclR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.207708  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3258  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 278 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1557  transcriptional regulator, putative  27.94 
 
 		 264 aa  92  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4766  IclR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5355  IclR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5506  IclR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1596  regulatory proteins, IclR  30.04 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134859 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0152  IclR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957112  normal  0.234996 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5401  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 260 aa  89  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1798  regulatory protein IclR  28.75 
 
 		 279 aa  89  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5307  IclR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 255 aa  89  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144609  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4817  IclR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384435 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0349  IclR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000127041  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2407  IclR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  26.67 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1572  IclR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1568  IclR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5040  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1189  IclR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1669  IclR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1587  IclR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0605  regulatory proteins, IclR  26.83 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1785  IclR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1642  IclR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4716  transcriptional regulator, IclR family  26.03 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3621  regulatory protein, IclR  24 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  20.99 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  24.15 
 
 		 303 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  24.19 
 
 		 249 aa  53.1  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2600  IclR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 249 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.248836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 263 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 275 aa  52  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  25.23 
 
 		 255 aa  52  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  26.01 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  23.25 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  25.56 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4436  transcriptional regulator, IclR family  20.99 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  24.49 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1022  IclR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.767316  normal  0.65898 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4517  regulatory protein, IclR  24.42 
 
 		 255 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530625  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2267  IclR family transcriptional regulator  20.92 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5288  regulatory protein, IclR  23.04 
 
 		 278 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.497587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  25.09 
 
 		 281 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  26.23 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 319 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02910  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 259 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186754 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  23.33 
 
 		 258 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  23.17 
 
 		 267 aa  49.3  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  25.48 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  28.16 
 
 		 291 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  23.47 
 
 		 280 aa  49.3  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  27.32 
 
 		 266 aa  49.3  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 284 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 294 aa  48.9  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0264  transcriptional regulator, IclR family  21.39 
 
 		 256 aa  48.9  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00966775  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  23 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6149  IclR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.508102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  26.36 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  27.8 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  23.11 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  23.11 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  23.11 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  23.11 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  23.11 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  30.06 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  21.76 
 
 		 294 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 294 aa  45.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3866  IclR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 246 aa  45.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 269 aa  45.4  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  21.15 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5781  transcriptional regulator, IclR family  26.34 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3872  regulatory protein, IclR  25.6 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.207868  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  21.15 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  21.51 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0430  IclR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0855586  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3480  transcriptional regulator, IclR family  23.44 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  25.13 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  21.15 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  21.15 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  21.15 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5126  transcriptional regulator, IclR family  27.4 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  22.63 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  21.15 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  21.15 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2930  regulatory proteins, IclR  39.71 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.232832  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>