127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2835 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2835  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 253 aa  503  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00508423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3354  regulatory protein, IclR  28.21 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.532058  decreased coverage  0.00226048 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3345  regulatory protein IclR  30.77 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.20582  normal  0.338935 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3337  regulatory protein IclR  30.77 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.423625 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3272  regulatory protein IclR  30.77 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0792755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3261  regulatory protein, IclR  30.77 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.798479  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3441  regulatory protein IclR  30.77 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0115656 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0757  putative transcription regulator protein  36.84 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0773  transcriptional regulator, IclR family  37.93 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.424221  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0707  transcriptional regulator, IclR family  37.93 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2652  IclR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0872  transcriptional regulator, TrmB  34.17 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2571  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3788  IclR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.65348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3861  regulatory proteins, IclR  27.49 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3792  regulatory proteins, IclR  27.49 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.711541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5773  transcriptional regulator, IclR family  27.51 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501857 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2399  regulatory protein, IclR  24.86 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2303  transcriptional regulator, IclR family  32.21 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584535 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 268 aa  52.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  26.14 
 
 		 257 aa  52  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  29.45 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  24.18 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4247  regulatory proteins, IclR  24.42 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  29.94 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  31.09 
 
 		 268 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 268 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2902  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  38.05 
 
 		 263 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 288 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  32.76 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  35.8 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0610  transcriptional regulator, IclR family  28.8 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  32.76 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  28.12 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4749  IclR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7626  IclR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  45.28 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  26.15 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  36.11 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 267 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  36.11 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  23.53 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 567 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3907  IclR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3903  IclR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  30.85 
 
 		 269 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 268 aa  45.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2024  transcriptional regulator, IclR family  31.08 
 
 		 281 aa  45.8  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.276218  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0777  transcriptional regulator, IclR family  33.9 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4660  IclR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 242 aa  45.8  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5102  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 		 268 aa  45.8  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.500204  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5311  regulatory protein, IclR  42.11 
 
 		 282 aa  45.4  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4732  IclR family transcriptional regulator family  48.98 
 
 		 274 aa  45.4  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0612254  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2267  IclR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 288 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1557  transcriptional regulator, putative  36.11 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5918  IclR family transcriptional regulator family  42.11 
 
 		 298 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0814  IclR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  38.05 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  32.26 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1787  transcriptional regulator, putative  34.88 
 
 		 180 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000180393  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3701  regulatory protein, IclR  44.68 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228275  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3476  IclR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  39.73 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  27.17 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20110  transcriptional regulator  29.08 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7143  IclR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  45.83 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>