104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3354 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3354  regulatory protein, IclR  100 
 
 
253 aa  515  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.532058  decreased coverage  0.00226048 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3337  regulatory protein IclR  79.37 
 
 
228 aa  363  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.423625 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3272  regulatory protein IclR  78.92 
 
 
228 aa  360  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0792755 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3441  regulatory protein IclR  78.92 
 
 
228 aa  360  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0115656 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3261  regulatory protein, IclR  78.92 
 
 
228 aa  360  9e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.798479  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3345  regulatory protein IclR  78.48 
 
 
228 aa  358  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.20582  normal  0.338935 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2835  transcriptional regulator, IclR family  28.21 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00508423  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
268 aa  62.8  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
284 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2571  IclR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  27.89 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  28.77 
 
 
291 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7060  IclR family transcriptional regulator  24.68 
 
 
280 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.579294  normal  0.280018 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  28.87 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0198  Transcriptional regulator IclR  27.07 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101079  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3648  transcriptional regulator, IclR family  28.37 
 
 
263 aa  55.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1546  IclR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00070993  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4339  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.29 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  25.24 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 
295 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2303  transcriptional regulator, IclR family  27.96 
 
 
244 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584535 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2380  IclR family transcriptional regulator  26.2 
 
 
254 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102909  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2795  transcriptional regulator, IclR family  30.63 
 
 
282 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.29633 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
268 aa  49.3  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  25.32 
 
 
265 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0340  IclR family transcriptional regulator  22.87 
 
 
260 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 
255 aa  48.9  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  24.07 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  24.5 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  26.09 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  26.09 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  27.8 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  25.71 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3974  transcriptional regulator, IclR family  25.38 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.482822  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
260 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 
263 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
274 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  30.71 
 
 
309 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
285 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  25.57 
 
 
284 aa  46.2  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  24.77 
 
 
272 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7484  IclR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
261 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  24.3 
 
 
295 aa  46.2  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1022  Transcriptional regulator IclR  24.82 
 
 
255 aa  45.4  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  20.37 
 
 
263 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2407  IclR family transcriptional regulator  25.11 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  24.41 
 
 
269 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  24.32 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  24.55 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0408  IclR family transcriptional regulator  28.67 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.317858  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  29.3 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  25.78 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0872  transcriptional regulator, TrmB  27.11 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  30.26 
 
 
261 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  26.23 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5039  transcriptional regulator, IclR family  31.69 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  21.34 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  25.78 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  29.86 
 
 
249 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  26.51 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  26.51 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  24.29 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  31.15 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  26.55 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5126  transcriptional regulator, IclR family  25.37 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  26.55 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  27.57 
 
 
276 aa  43.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  27.91 
 
 
280 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4911  putative transcriptional regulator  28.87 
 
 
256 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.803448  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  30.84 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  23.46 
 
 
262 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
260 aa  43.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  27.67 
 
 
267 aa  42.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0667  regulatory protein IclR  30.89 
 
 
252 aa  42.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
285 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
281 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
285 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
285 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3476  IclR family transcriptional regulator  21.49 
 
 
261 aa  42.4  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
285 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  27.67 
 
 
267 aa  42.7  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
285 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3050  regulatory proteins, IclR  25.69 
 
 
251 aa  42.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  24.12 
 
 
268 aa  42.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  23.21 
 
 
254 aa  42.4  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4432  IclR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
271 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
310 aa  42  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
284 aa  42  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
285 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
286 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
284 aa  42  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
284 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
284 aa  42  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
284 aa  42  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
284 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
284 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>