144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1527 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1527  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 257 aa  535  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1566  IclR family transcriptional regulator  60.41 
 
 		 255 aa  329  3e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.207708  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1557  transcriptional regulator, putative  60.24 
 
 		 264 aa  315  7e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3258  IclR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 278 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0152  IclR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957112  normal  0.234996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5355  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5506  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1596  regulatory proteins, IclR  31.74 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134859 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4766  IclR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6484  regulatory protein, IclR  28.63 
 
 		 259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476341  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1798  regulatory protein IclR  29.55 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5307  IclR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144609  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5401  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0315  regulatory protein, IclR  26.88 
 
 		 279 aa  89.7  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1568  IclR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3621  regulatory protein, IclR  25.55 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1587  IclR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  24.19 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4817  IclR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384435 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3480  transcriptional regulator, IclR family  25.74 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0605  regulatory proteins, IclR  24.5 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  26.32 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1572  IclR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  25.12 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5040  transcriptional regulator, IclR family  24.9 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2600  IclR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.248836 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1189  IclR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1669  IclR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  26.46 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 259 aa  62  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1642  IclR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  25.41 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  26.36 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  23.27 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4716  transcriptional regulator, IclR family  26.7 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  26.09 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  27.89 
 
 		 336 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1811  regulatory proteins, IclR  22.36 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4517  regulatory protein, IclR  22.27 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530625  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4108  transcriptional regulator, IclR family  26.24 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  25.13 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  21.55 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  21.54 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  26.88 
 
 		 258 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 258 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3765  IclR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 272 aa  52.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  24.81 
 
 		 276 aa  52  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2422  IclR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 260 aa  52  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  23.68 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  23.28 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3872  regulatory protein, IclR  22.13 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.207868  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0101  transcriptional regulator, TrmB  21.62 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  20.54 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  20.3 
 
 		 297 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  20.3 
 
 		 297 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  22.67 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  20.3 
 
 		 297 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  26.26 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  23.08 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0362  IclR family transcriptional regulator  21.59 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2407  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1785  IclR family transcriptional regulator  19.46 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0349  IclR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000127041  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  23.46 
 
 		 257 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  19.5 
 
 		 271 aa  48.9  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3701  regulatory protein, IclR  23.33 
 
 		 268 aa  48.5  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228275  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  20.51 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  22.22 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2705  regulatory proteins, IclR  24.21 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0906  regulatory proteins, IclR  22.32 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0596  regulatory protein, IclR  20.93 
 
 		 293 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3124  IclR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.845824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5473  regulatory protein IclR  20.67 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  23.2 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7060  IclR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.579294  normal  0.280018 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  22.27 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3024  DNA-binding transcriptional activator MhpR  29.79 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3915  transcriptional regulator  21.77 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504106  normal  0.604915 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5918  IclR family transcriptional regulator family  23.5 
 
 		 298 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3751  DNA-binding transcriptional activator MhpR  29.79 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0686  regulatory protein, IclR  19.8 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  18.75 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2601  IclR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505615  normal  0.0687199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  20.1 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3950  IclR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 267 aa  46.2  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000408149  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  19.15 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  18.88 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  20 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  20.96 
 
 		 251 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3492  regulatory proteins, IclR  22.86 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2147  IclR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  18.92 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  22.36 
 
 		 257 aa  45.4  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  19.6 
 
 		 263 aa  45.8  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0645  transcriptional regulator, IclR family  22.22 
 
 		 259 aa  45.4  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  19.83 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>