More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2734 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2734  ABC transporter related  100 
 
 
354 aa  679    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.188304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2547  ABC transporter related  90.34 
 
 
354 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9029  putative ATP-binding component of ABC transporter  66.28 
 
 
343 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  59.94 
 
 
347 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1948  ABC transporter related  59.37 
 
 
344 aa  356  3.9999999999999996e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2820  ABC transporter related protein  59.26 
 
 
349 aa  350  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0326  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components  56.82 
 
 
352 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.099755  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2557  ABC transporter related protein  56.25 
 
 
402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000490216  normal  0.117456 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  53.03 
 
 
384 aa  322  7e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4968  ABC transporter related protein  55.49 
 
 
350 aa  300  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2272  ABC transporter related  49.09 
 
 
385 aa  290  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2810  ABC transporter related protein  46.65 
 
 
367 aa  248  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34120  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  46.72 
 
 
372 aa  237  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.667673  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3986  ABC transporter related  58.33 
 
 
247 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1067  ABC transporter related  45.89 
 
 
346 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67887  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2904  ABC transporter related  45.92 
 
 
371 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000149556  hitchhiker  0.0000207789 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11887  molybdenum-transport ATP-binding protein ABC transporter modC  42 
 
 
369 aa  210  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.189327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3746  ABC transporter related  42.98 
 
 
358 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2824  ABC transporter related  46.2 
 
 
358 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2797  ABC transporter related  46.2 
 
 
358 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2841  ABC transporter related  46.2 
 
 
358 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  43 
 
 
342 aa  203  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  42.77 
 
 
346 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18140  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  44.35 
 
 
347 aa  200  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0277574  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  42.77 
 
 
346 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  42.77 
 
 
346 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  42.9 
 
 
383 aa  199  7.999999999999999e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  32.18 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  40 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  43.36 
 
 
347 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4175  ABC transporter related  50.5 
 
 
391 aa  196  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  40.18 
 
 
341 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  43.64 
 
 
360 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  41.37 
 
 
348 aa  195  9e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3861  ABC transporter related  46.38 
 
 
358 aa  195  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3481  ABC transporter related  41.6 
 
 
361 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2188  ABC transporter related  46.18 
 
 
331 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321359  normal  0.0854414 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31190  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  42.6 
 
 
348 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264527  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2898  ABC transporter related  39.26 
 
 
366 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00959734 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  40.51 
 
 
363 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3724  ABC transporter related  49.55 
 
 
328 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  45.87 
 
 
342 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3424  ABC transporter related  49.09 
 
 
328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.35 
 
 
375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1561  ABC transporter related  39.09 
 
 
359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  43.4 
 
 
342 aa  190  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.11 
 
 
349 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  47.51 
 
 
349 aa  189  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  43.88 
 
 
389 aa  189  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  47.42 
 
 
342 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1606  ABC transporter related  36.7 
 
 
394 aa  189  7e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256543  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3337  ABC transporter related  42.42 
 
 
367 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  43.32 
 
 
337 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.83 
 
 
359 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  39.26 
 
 
341 aa  187  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2536  ABC transporter-related protein  45.75 
 
 
359 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  39.3 
 
 
362 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 
333 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  46.85 
 
 
353 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  47.3 
 
 
353 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.8 
 
 
354 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2991  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.07 
 
 
384 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  39.74 
 
 
353 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  42.91 
 
 
399 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  32.75 
 
 
347 aa  186  5e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  45.91 
 
 
349 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07110  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  42.34 
 
 
389 aa  186  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  45.5 
 
 
353 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1464  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  34.51 
 
 
350 aa  186  6e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  46.33 
 
 
342 aa  186  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  45.91 
 
 
349 aa  185  8e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  46.61 
 
 
377 aa  185  9e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  41.09 
 
 
333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  41.09 
 
 
366 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  41.09 
 
 
333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2085  ABC-type transport system, putative ATPase component  46.43 
 
 
345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218522  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  42.39 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  46.95 
 
 
349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  46.33 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2745  ABC transporter ATP-binding protein  34.69 
 
 
367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.870827  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.22 
 
 
375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  39.22 
 
 
363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4846  ABC transporter, ATPase subunit  38.35 
 
 
359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  decreased coverage  0.000133931 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  37.69 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0353  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.98 
 
 
366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00527297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  45.32 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  45.45 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1735  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.78 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000353928 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  41.12 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.81 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  46.79 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.53 
 
 
362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.22 
 
 
375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  41.09 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3016  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.23 
 
 
384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  38.95 
 
 
354 aa  184  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1657  ABC transporter related  38.53 
 
 
359 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.79 
 
 
384 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888136  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  44.34 
 
 
387 aa  183  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>