176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3213 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  59.18 
 
 		 997 aa  1179    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  66.06 
 
 		 994 aa  1338    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  100 
 
 		 1001 aa  2048    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  39.35 
 
 		 993 aa  679    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  35.98 
 
 		 972 aa  550  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  32.14 
 
 		 1007 aa  452  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1066 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1007 aa  398  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 1066 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.66 
 
 		 1050 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 991 aa  361  4e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 1007 aa  349  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  29.42 
 
 		 1037 aa  343  8e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02821  OmpA-related protein  36.31 
 
 		 485 aa  266  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00282883  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  27.57 
 
 		 1054 aa  128  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 1041 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  25.56 
 
 		 1122 aa  111  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  25.56 
 
 		 1120 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  22.82 
 
 		 986 aa  110  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1109 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  22.08 
 
 		 1010 aa  103  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  26.37 
 
 		 1057 aa  101  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1008 aa  101  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1126 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 1176 aa  95.1  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 1188 aa  90.5  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  25.56 
 
 		 1203 aa  89.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1075 aa  89.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  23.25 
 
 		 1012 aa  89  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1075 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1068 aa  87.4  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 1232 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1071 aa  83.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  24.28 
 
 		 1081 aa  83.2  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  22.48 
 
 		 1008 aa  82.4  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  22.22 
 
 		 1051 aa  81.3  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  22.41 
 
 		 992 aa  81.3  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1053 aa  80.9  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 1026 aa  80.1  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1067 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  22.94 
 
 		 1068 aa  80.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 1008 aa  79.7  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1066 aa  79.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  22.88 
 
 		 1061 aa  77.8  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1125 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 1123 aa  77  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  24.8 
 
 		 1008 aa  76.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  27 
 
 		 1196 aa  75.5  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  24.32 
 
 		 1116 aa  75.1  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1052 aa  74.7  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 1149 aa  73.9  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  25.08 
 
 		 1125 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1077 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1100 aa  72.4  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 1087 aa  71.6  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1069 aa  71.2  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1162 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 897 aa  70.5  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 1105 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  21.85 
 
 		 1123 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 1114 aa  70.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  22.08 
 
 		 1056 aa  70.1  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 952 aa  69.7  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 1153 aa  68.2  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  23.58 
 
 		 511 aa  67.4  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  24.93 
 
 		 1066 aa  67.4  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1129 aa  67  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1122 aa  66.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  24.75 
 
 		 1195 aa  65.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  23.96 
 
 		 1071 aa  65.5  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  21.89 
 
 		 1206 aa  64.7  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 836 aa  64.7  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1141 aa  64.3  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  25.88 
 
 		 1210 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1105 aa  62  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  22.82 
 
 		 1074 aa  61.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 828 aa  61.2  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1173 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  23.92 
 
 		 1194 aa  60.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 1089 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  21.91 
 
 		 979 aa  59.7  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 1065 aa  59.3  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 935 aa  58.9  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  22.98 
 
 		 1162 aa  58.9  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 1016 aa  58.2  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 661 aa  57.8  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 888 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 1105 aa  57.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 781 aa  57.4  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  23.9 
 
 		 1097 aa  57.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0509  TonB-dependent receptor  22.11 
 
 		 743 aa  57.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 743 aa  57  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 1147 aa  57  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0522  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 727 aa  57  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.569695 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 866 aa  57  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 845 aa  55.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  29.45 
 
 		 895 aa  55.8  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 828 aa  54.3  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 749 aa  53.5  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  21.03 
 
 		 662 aa  53.5  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>