58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2907 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2907  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  696    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  69.9 
 
 		 3333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2167  YD repeat-containing protein  55.36 
 
 		 622 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  44.94 
 
 		 2283 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  71.62 
 
 		 2448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  86.44 
 
 		 2401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  67.09 
 
 		 2437 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  82.69 
 
 		 2402 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  65.38 
 
 		 1854 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  63.27 
 
 		 2762 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  59.18 
 
 		 2497 aa  77  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  63.27 
 
 		 2513 aa  76.3  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  59.18 
 
 		 2413 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  59.18 
 
 		 722 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  57.14 
 
 		 2428 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  57.14 
 
 		 2416 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  37.84 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  46.3 
 
 		 482 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  35.71 
 
 		 554 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0053  YD repeat protein  40.32 
 
 		 2075 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.192291  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0160  YD repeat protein  50 
 
 		 2165 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  48.98 
 
 		 2494 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  53.06 
 
 		 1834 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  54.17 
 
 		 1953 aa  53.5  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0177  hypothetical protein  46.94 
 
 		 232 aa  53.5  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3660  YD repeat-containing protein  46.15 
 
 		 2007 aa  52.8  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  42 
 
 		 628 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  47.92 
 
 		 2286 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  45.28 
 
 		 2542 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1230  YD repeat protein  45.9 
 
 		 2191 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249326 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  37.7 
 
 		 2942 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  44.64 
 
 		 1140 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3664  hypothetical protein  32.26 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375462  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0133  hypothetical protein  29.31 
 
 		 520 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.800968  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2324  YD repeat-containing protein  45.45 
 
 		 765 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.2713  decreased coverage  0.00718158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  40.82 
 
 		 6109 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  38.78 
 
 		 1517 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1491  YD repeat-containing protein  52.27 
 
 		 1658 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  44.68 
 
 		 2615 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2231  YD repeat protein  46.15 
 
 		 982 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  42.31 
 
 		 1682 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  40.91 
 
 		 2031 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  40.91 
 
 		 2031 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  40.91 
 
 		 2032 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  40.91 
 
 		 1825 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  40.91 
 
 		 1806 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  40.91 
 
 		 2031 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  40.91 
 
 		 1825 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  38.46 
 
 		 2096 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  38.89 
 
 		 1753 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3696  hypothetical protein  37.1 
 
 		 273 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2123  YD repeat protein  37.93 
 
 		 1073 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  26.21 
 
 		 1917 aa  43.5  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  36.73 
 
 		 2094 aa  43.1  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6407  YD repeat protein  39.22 
 
 		 2194 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3077  hypothetical protein  44.19 
 
 		 299 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1458  hypothetical protein  43.75 
 
 		 391 aa  42.7  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  31.34 
 
 		 2486 aa  42.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>