132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2018 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2018  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 173 aa  323  6e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401089 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3832  Smr protein/MutS2  51.13 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.334235  normal  0.0950687 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0582  Smr protein/MutS2  51.28 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146965  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2853  Smr protein/MutS2  40.17 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241064  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3443  Smr protein/MutS2  36.36 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2787  Smr protein/MutS2  40.87 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1241  putative Smr protein/MutS2  36.84 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0189  Smr protein/MutS2  34.1 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524914  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2902  Smr protein/MutS2  36.84 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0154  hypothetical protein  31.58 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1246  Smr protein/MutS2  35.29 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.731198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0279  Smr protein/MutS2 C-terminal  31.36 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2678  Smr protein/MutS2  36.36 
 
 		 198 aa  67.4  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0301  Smr protein/MutS2  37.61 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  37.29 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0119  Smr protein/MutS2  37.27 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0307  Smr protein/MutS2  33.94 
 
 		 194 aa  64.3  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0419  Smr protein/MutS2  34.57 
 
 		 198 aa  64.3  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  29.88 
 
 		 450 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  31.54 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  29.73 
 
 		 253 aa  62  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0952  Smr domain-containing protein  25.87 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2982  Smr protein/MutS2  28.74 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1144  Smr protein/MutS2  37.27 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00126532 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  37.61 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0797  Smr domain-containing protein  26.23 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  37.61 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0402  Smr protein/MutS2  34.91 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953066  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  29.23 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4246  Smr protein/MutS2  32.14 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214876  hitchhiker  0.0000000000382903 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  37.61 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0169  Smr domain-containing protein  28.57 
 
 		 369 aa  57.8  0.00000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3602  Smr protein/MutS2-like  34.4 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0423401  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  34.23 
 
 		 225 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  27.03 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3218  Smr protein/MutS2  34.51 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  32.2 
 
 		 364 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1886  Smr protein/MutS2  28.11 
 
 		 200 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1996  Smr family protein  32.32 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  29.09 
 
 		 213 aa  52.4  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3113  Smr protein/MutS2  33.04 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  31.53 
 
 		 223 aa  52  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2076  Smr family protein  32.32 
 
 		 200 aa  51.6  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3715  Smr protein/MutS2  36.11 
 
 		 211 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.465201 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2050  Smr protein/MutS2  36.67 
 
 		 196 aa  50.8  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1014  smr domain-containing protein  32.43 
 
 		 239 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.883954  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1000  Smr protein/MutS2  35.51 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3487  Smr protein/MutS2  31.45 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1293  Smr domain-containing protein  26.29 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.564372  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5040  Smr protein/MutS2  35.35 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0109  Smr protein/MutS2  29.49 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0302228 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  23.78 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  23.78 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  32.41 
 
 		 234 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0369  Smr protein/MutS2  29.73 
 
 		 236 aa  49.3  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1679  Smr protein/MutS2  37.37 
 
 		 262 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4270  Smr protein/MutS2  31.82 
 
 		 188 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  23.17 
 
 		 196 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0844  Smr protein/MutS2  31.93 
 
 		 205 aa  48.5  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  30.3 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0011  DNA repair protein  31.53 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27196  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0350  Smr protein/MutS2  29.73 
 
 		 232 aa  48.5  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000775937 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  30.28 
 
 		 224 aa  48.5  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  23.53 
 
 		 196 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  23.53 
 
 		 196 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  33.04 
 
 		 189 aa  48.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  23.53 
 
 		 213 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3944  Smr protein/MutS2  32.73 
 
 		 189 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  23.53 
 
 		 196 aa  47.8  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  23.53 
 
 		 196 aa  47.8  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  32.14 
 
 		 189 aa  47.8  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  25.69 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  29.85 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  25.69 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  32.73 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  29.09 
 
 		 197 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1815  hypothetical protein  30.2 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  32.73 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495  Smr domain-containing protein  23.78 
 
 		 196 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  28.83 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3112  Smr protein/MutS2  28.57 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  31.58 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2341  Smr protein/MutS2  28.83 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  32.73 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  32.73 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  27.52 
 
 		 180 aa  45.4  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1376  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104289  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  25.89 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  31.82 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  32 
 
 		 189 aa  44.7  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01397  Smr domain (Small MutS Related) containing protein  27.61 
 
 		 195 aa  44.7  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  27.43 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  30.91 
 
 		 185 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1893  Smr protein/MutS2  31.19 
 
 		 197 aa  44.3  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  30.28 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  28.95 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  31.58 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  30.28 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  30.56 
 
 		 266 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>