More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0389 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 166 aa  337  2.9999999999999998e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  49.38 
 
 		 163 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  36.53 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  34.3 
 
 		 172 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  36.09 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  34.1 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  32.76 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  32.76 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  35.93 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  35.09 
 
 		 171 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  40.35 
 
 		 157 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  39.32 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  38.94 
 
 		 211 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  33.14 
 
 		 166 aa  94.7  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  30.68 
 
 		 176 aa  91.3  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  31.36 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  35 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  41.75 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  35.04 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 		 169 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  31.61 
 
 		 164 aa  89  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 		 156 aa  88.6  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 		 147 aa  88.2  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  33.77 
 
 		 164 aa  87.4  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  30.6 
 
 		 184 aa  87.4  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  36.5 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  40.2 
 
 		 153 aa  86.3  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  28.49 
 
 		 168 aa  85.5  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  35.4 
 
 		 175 aa  85.5  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  30.86 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 		 167 aa  85.1  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  38.68 
 
 		 162 aa  84.7  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  41.41 
 
 		 152 aa  84.7  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  44.55 
 
 		 150 aa  84.7  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  29.61 
 
 		 167 aa  84.7  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  30.5 
 
 		 155 aa  84.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  39.05 
 
 		 164 aa  84.3  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  39.05 
 
 		 164 aa  84.3  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 		 177 aa  84.3  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  46.91 
 
 		 169 aa  84.3  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3192  HSP20 family protein  34.62 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  27.86 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  28.07 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  37.74 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  43.01 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7808  Hsp20 family heat-shock protein  43.16 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00255696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  37.25 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 204 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  31.16 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  29.5 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  35.24 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2731  heat shock protein Hsp20  29.63 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2401  heat shock protein Hsp20  32.77 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000662378  hitchhiker  0.00157329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 		 146 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  32.3 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  30.29 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  30.29 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  33.9 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  40.22 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  35.96 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  30.22 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  30.83 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  28.49 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  31.25 
 
 		 231 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  30.19 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  36.27 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  26.57 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  31.73 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  40.78 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  26.57 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  40.78 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  27.94 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  26.09 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  42.86 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  28.17 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  33.09 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  32.71 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  35.54 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  34.4 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  27.94 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  27.94 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3061  heat shock protein Hsp20  28.17 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  30 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>