65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2863 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  100 
 
 		 107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2906  hypothetical protein  34.38 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.808157  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2919  hypothetical protein  31.78 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000876891  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.94 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.588155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0564  hypothetical protein  33.33 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2287  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.78 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.709012  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  30.61 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.61 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.9 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.39 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  34.78 
 
 		 132 aa  50.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  32.95 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  33.75 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3262  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  34.78 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.232764  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  30 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00420  cupin domain-containing protein  27.78 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1317  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.96 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.25 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  31.4 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2588  cupin region  29.47 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  30.99 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1738  cupin 2, barrel  30.95 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.39391  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  35.82 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 370 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  31.33 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2044  hypothetical protein  38.98 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  28.77 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1035  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 179 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  32.53 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  36.11 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1439  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 199 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.83171  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.88 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.86 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0905  cupin 2 domain-containing protein  32.89 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.52502  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.49 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  28.4 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1364  hypothetical protein  30.61 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  34.43 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  24.49 
 
 		 219 aa  43.9  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1285  cupin region  35.62 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1054  cupin family protein  30.38 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2610  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.08 
 
 		 199 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  35.14 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  32.79 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  34.33 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3665  hypothetical protein  31.88 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1207  cupin 2 domain-containing protein  27.36 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.67 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.4 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 136 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.367225  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0553  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.21 
 
 		 136 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  30.56 
 
 		 87 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.44 
 
 		 113 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  25.71 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  26.42 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  28.42 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.14 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.73 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  27.78 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1599  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.76 
 
 		 108 aa  40  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00522565 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2303  hypothetical protein  29.91 
 
 		 109 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000111298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>