More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1830 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  100 
 
 		 511 aa  1023    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  50.3 
 
 		 478 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  46.6 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  45.17 
 
 		 508 aa  378  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  41.63 
 
 		 498 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  45.73 
 
 		 489 aa  365  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  42.8 
 
 		 536 aa  359  6e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  43.58 
 
 		 513 aa  353  5e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  41.07 
 
 		 551 aa  352  7e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  43.14 
 
 		 506 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  41.29 
 
 		 521 aa  347  2e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  41.04 
 
 		 521 aa  344  2.9999999999999997e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  43.35 
 
 		 521 aa  340  4e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  39.87 
 
 		 518 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  39.46 
 
 		 518 aa  320  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  38.85 
 
 		 504 aa  318  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  35.04 
 
 		 527 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  33.52 
 
 		 551 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  35.55 
 
 		 549 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  35.07 
 
 		 554 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  35.07 
 
 		 554 aa  250  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  30.91 
 
 		 546 aa  250  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  34.87 
 
 		 563 aa  249  8e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  35.39 
 
 		 551 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  35.39 
 
 		 551 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  31.2 
 
 		 546 aa  249  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  35.7 
 
 		 544 aa  246  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4279  multicopper oxidase type 3  51.32 
 
 		 545 aa  244  3.9999999999999997e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  33.01 
 
 		 556 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  31.16 
 
 		 705 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  31.78 
 
 		 561 aa  232  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  31.19 
 
 		 566 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  28.85 
 
 		 568 aa  225  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  28.92 
 
 		 568 aa  225  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  30.23 
 
 		 561 aa  223  6e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  28.4 
 
 		 568 aa  217  4e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  31.95 
 
 		 565 aa  205  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3235  multicopper oxidase type 2  33.33 
 
 		 502 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1132  multicopper oxidase, type 2  32.78 
 
 		 504 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3078  multicopper oxidase, type 3  27.29 
 
 		 871 aa  196  9e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  29.61 
 
 		 513 aa  195  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  34.78 
 
 		 497 aa  195  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  33.04 
 
 		 483 aa  190  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  37.65 
 
 		 621 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  34.29 
 
 		 460 aa  189  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3882  twin-arginine translocation pathway signal  31.38 
 
 		 499 aa  183  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  30.49 
 
 		 515 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  32.5 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  32.5 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  34.72 
 
 		 456 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  31.74 
 
 		 601 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  32.67 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  31.45 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  31.45 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  33.97 
 
 		 605 aa  177  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  30.16 
 
 		 460 aa  177  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  31.11 
 
 		 476 aa  176  7e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  32.48 
 
 		 463 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  36.2 
 
 		 611 aa  176  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  31.46 
 
 		 601 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  30.97 
 
 		 468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  33.88 
 
 		 638 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  31.33 
 
 		 457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  30.6 
 
 		 459 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  31.33 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  33.41 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  34.31 
 
 		 606 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09170  conserved hypothetical protein: exracellular laccase (Eurofung)  29.18 
 
 		 570 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  30.56 
 
 		 460 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  34.85 
 
 		 673 aa  171  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  31.62 
 
 		 460 aa  170  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  34.98 
 
 		 592 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  32.73 
 
 		 589 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  32.75 
 
 		 637 aa  168  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  31.05 
 
 		 461 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  34.88 
 
 		 594 aa  167  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  29.55 
 
 		 576 aa  167  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  34.55 
 
 		 584 aa  166  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  32.91 
 
 		 621 aa  165  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  33.23 
 
 		 590 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  35.17 
 
 		 569 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  32.74 
 
 		 460 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  30.5 
 
 		 656 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  32.34 
 
 		 463 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  32.89 
 
 		 604 aa  163  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  32.2 
 
 		 574 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  32.44 
 
 		 809 aa  163  8.000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00405  Multicopper oxidase  33.23 
 
 		 604 aa  163  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2422  copper-resistance protein CopA  33.54 
 
 		 593 aa  161  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  30.91 
 
 		 580 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  38.79 
 
 		 330 aa  159  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  35.66 
 
 		 505 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  33.33 
 
 		 607 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  33.43 
 
 		 572 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  31.1 
 
 		 619 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  30.14 
 
 		 652 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  30.14 
 
 		 652 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  30.14 
 
 		 671 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1850  copper-resistance protein, CopA family  34.65 
 
 		 659 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  hitchhiker  0.0000000000246272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  32.25 
 
 		 630 aa  157  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>