62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3731 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  56.05 
 
 		 1171 aa  1325    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  35.71 
 
 		 1205 aa  660    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  100 
 
 		 1174 aa  2424    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  35.16 
 
 		 1144 aa  640    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  35.81 
 
 		 1180 aa  649    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  51.55 
 
 		 1182 aa  1226    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  57.6 
 
 		 1162 aa  1339    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  37.5 
 
 		 1160 aa  707    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  44.49 
 
 		 1183 aa  992    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  41.31 
 
 		 1140 aa  858    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  38.58 
 
 		 1131 aa  772    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  33.07 
 
 		 1219 aa  597  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  34.52 
 
 		 1167 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  44.22 
 
 		 612 aa  499  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  36.39 
 
 		 1218 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2207  hypothetical protein  53.89 
 
 		 332 aa  353  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000153099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1270 aa  350  6e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1125 aa  238  6e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1241 aa  229  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1324 aa  209  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  23.44 
 
 		 1359 aa  208  5e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1430 aa  207  9e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1425 aa  176  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1162 aa  170  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1484 aa  166  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  29.14 
 
 		 1141 aa  158  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1174 aa  154  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1154 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  27.41 
 
 		 731 aa  146  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1154 aa  141  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1326 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1107 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1129 aa  133  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  22.22 
 
 		 882 aa  129  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  23.82 
 
 		 706 aa  121  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  26.55 
 
 		 1497 aa  113  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  28.35 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  22.24 
 
 		 995 aa  75.1  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1177 aa  67  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  23.19 
 
 		 1058 aa  67  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2491  hypothetical protein  35.92 
 
 		 106 aa  67  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  25.73 
 
 		 1239 aa  65.1  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  34.78 
 
 		 950 aa  62.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0991  hypothetical protein  36.96 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  29.63 
 
 		 288 aa  60.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  22.2 
 
 		 1120 aa  59.7  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  20.08 
 
 		 1178 aa  58.5  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  31.71 
 
 		 974 aa  57.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  21.41 
 
 		 1159 aa  57.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1231 aa  55.5  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  21.75 
 
 		 1036 aa  53.1  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1173 aa  51.6  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1195 aa  50.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  42.65 
 
 		 416 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  32.69 
 
 		 578 aa  47.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  32.69 
 
 		 578 aa  47.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  26.67 
 
 		 1076 aa  47.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  21.7 
 
 		 1209 aa  47  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1426 aa  46.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  36 
 
 		 518 aa  46.2  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4877  hypothetical protein  27.96 
 
 		 481 aa  45.8  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  24.86 
 
 		 1041 aa  45.1  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>