More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3423 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3423  protein kinase  100 
 
 		 402 aa  788    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0410909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3130  putative serine protease  81.73 
 
 		 404 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0656366  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3867  forkhead-associated protein  81.48 
 
 		 404 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2284  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.44 
 
 		 514 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  34.48 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  34.9 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  33.52 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  35.63 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  39.77 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1761  2-alkenal reductase  32.68 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000380843  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  33.16 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  30.29 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4575  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.6 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  27.35 
 
 		 442 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  30.22 
 
 		 425 aa  76.3  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  31.12 
 
 		 473 aa  75.5  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  32.29 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.14 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  33.33 
 
 		 515 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.14 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02461  serine protease  34.18 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  33.66 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  31.44 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.3 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1808  trypsin-like serine protease  34.34 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000335064  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  33.17 
 
 		 383 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  33.01 
 
 		 485 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  32.99 
 
 		 483 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2398  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.45 
 
 		 531 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  34 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  31.63 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  31.77 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  32.2 
 
 		 469 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  30.68 
 
 		 383 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3211  predicted protein  32 
 
 		 331 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  33.9 
 
 		 583 aa  72  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  30.68 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  30.64 
 
 		 525 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  34.86 
 
 		 347 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  31.63 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  34.91 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  29.69 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  31.03 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  33.17 
 
 		 383 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  31.75 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.17 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2267  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.04 
 
 		 803 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.489099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2320  PDZ/DHR/GLGF  35.15 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4798  2-alkenal reductase  39.08 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5265  2-alkenal reductase  39.08 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.18 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1966  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.68 
 
 		 578 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  31.55 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0793  2-alkenal reductase  38.22 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5341  2-alkenal reductase  38.51 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  32.51 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  31.44 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.18 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01021  serine protease  32.34 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.425044  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  28.51 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1471  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.52 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284694  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  34.88 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  32.12 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  31.89 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.35 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2072  PDZ/DHR/GLGF  35.71 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  32.32 
 
 		 594 aa  69.3  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0414  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.9 
 
 		 481 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.39 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1353  trypsin-like serine protease  30.88 
 
 		 673 aa  68.9  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16701  trypsin-like serine protease  33.33 
 
 		 376 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  32.24 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1209  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.95 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0415  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.16 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  30.61 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0372  PDZ/DHR/GLGF  35 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.880544  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  29.08 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  29.74 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0386  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.9 
 
 		 484 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  29.08 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4001  2-alkenal reductase  30.33 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  29.95 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04311  trypsin-like serine protease  35.12 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16811  trypsin-like serine protease  33.93 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1127  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.16 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0664983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  33.96 
 
 		 476 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.84 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16941  trypsin-like serine protease  34.52 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  33.33 
 
 		 479 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  29.74 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2917  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.88 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0069  trypsin-like serine protease  29.17 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0357916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  33.95 
 
 		 476 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  32.73 
 
 		 474 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  30.05 
 
 		 512 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.61 
 
 		 401 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1379  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.51 
 
 		 495 aa  67  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.94 
 
 		 392 aa  67  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  35.91 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2439  trypsin-like serine protease  29.19 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0015948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>