228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2612 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  100 
 
 		 258 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  74.1 
 
 		 260 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  73.71 
 
 		 260 aa  329  3e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2954  flagellar biosynthetic protein FliR  43.6 
 
 		 259 aa  191  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  47.44 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3257  flagellar biosynthesis protein FliR  49.35 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  36.8 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  38.8 
 
 		 258 aa  122  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  35.74 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  34.54 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  34.47 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  38.4 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  36.52 
 
 		 256 aa  109  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  39.2 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  32.35 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  35.35 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  35.78 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  33.06 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  34.04 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  35.47 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  29.58 
 
 		 253 aa  98.6  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  37.67 
 
 		 256 aa  95.5  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  35.44 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  29.29 
 
 		 265 aa  93.2  4e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2627  flagellar biosynthetic protein FliR  35.75 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1699  flagellar biosynthesis protein FliR  32.48 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0271  flagellar biosynthesis protein FliR  33.04 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130948  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  32.16 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  30.25 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  32.52 
 
 		 248 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0050  type III secretion system inner membrane R protein  32.17 
 
 		 249 aa  89  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3589  flagellar biosynthesis protein FliR  32.73 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  32.57 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  31.82 
 
 		 250 aa  85.5  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  28.7 
 
 		 250 aa  85.5  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6516  flagellar biosynthesis protein FliR  30.04 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  31.98 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  30.53 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0665  flagellar biosynthesis protein FliR  29.66 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  31.96 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  28.82 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  31.22 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  31.51 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  33.2 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  31.51 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  31.51 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  31.51 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  31.51 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  31.51 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  31.05 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  28.76 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0700656  normal  0.100777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0691  flagellar biosynthesis protein FliR  28.76 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  31.51 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  28.44 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  28.44 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  27.98 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  33.66 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  29.68 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  33.47 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  28.57 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  28.99 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  28.82 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  27.93 
 
 		 264 aa  72  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  28.45 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  28.18 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  29.76 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  30.2 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  24.2 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1630  flagellar biosynthesis protein FliR  27.52 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  27.97 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  26.94 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1632  flagellar biosynthetic protein FliR  24.26 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  27.11 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  26.89 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  28.45 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  29.17 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  27.11 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  29.58 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  30.73 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  29.28 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0215  flagellar biosynthetic protein FliR  30.67 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  27.94 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1564  flagellar biosynthetic protein FliR  29.22 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  26.11 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  28.63 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  28.14 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  27.01 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  23.53 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  29.17 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  30.97 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  28.51 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  27.8 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  30.97 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  27.54 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  27.57 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  26.13 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  29.69 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1438  flagellar biosynthesis protein FliR  26.21 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  31.03 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  27.43 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>