More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1883 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1883  glutathione peroxidase  100 
 
 		 152 aa  312  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  83.44 
 
 		 176 aa  260  6e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  82.78 
 
 		 176 aa  258  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3273  glutathione peroxidase  56.08 
 
 		 174 aa  157  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2055  putative glutathione peroxidase  54.05 
 
 		 177 aa  153  9e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.265735 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  48.84 
 
 		 208 aa  140  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  47.29 
 
 		 212 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  43.71 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  48.06 
 
 		 231 aa  133  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  48.06 
 
 		 231 aa  133  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  48.84 
 
 		 233 aa  133  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  48.55 
 
 		 191 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  43.79 
 
 		 159 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  45.67 
 
 		 185 aa  130  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0316  glutathione peroxidase  46.71 
 
 		 184 aa  130  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.282271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0360  glutathione peroxidase  46.71 
 
 		 184 aa  130  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  48.55 
 
 		 199 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  43.79 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  43.79 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  43.79 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  43.79 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  43.79 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  43.79 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  43.79 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1782  glutathione peroxidase  46.58 
 
 		 193 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  45.74 
 
 		 202 aa  128  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0392  glutathione peroxidase  46.05 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0773128  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  45 
 
 		 184 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  45 
 
 		 184 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5475  glutathione peroxidase  45.21 
 
 		 189 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416682  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  43.54 
 
 		 183 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  47.2 
 
 		 195 aa  127  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  44.3 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  46.92 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  45.7 
 
 		 195 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  46.92 
 
 		 195 aa  124  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  44.96 
 
 		 189 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  46.43 
 
 		 185 aa  124  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  46.92 
 
 		 213 aa  123  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  40.67 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  43.14 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  44.08 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  43.14 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  43.14 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  42.31 
 
 		 183 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  42.31 
 
 		 184 aa  120  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  41.18 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  44.19 
 
 		 208 aa  120  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  42.03 
 
 		 192 aa  120  8e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  43.79 
 
 		 159 aa  120  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  42.48 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  40.52 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  40.77 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  40.52 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  41.94 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  43.42 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  41.29 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  44.62 
 
 		 185 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  39.07 
 
 		 165 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  42.11 
 
 		 162 aa  116  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  40.15 
 
 		 186 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  40.71 
 
 		 180 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3929  glutathione peroxidase  42.76 
 
 		 188 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.592022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  39.07 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  39.07 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  41.18 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06070  glutathione peroxidase  42.67 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0876  Peroxiredoxin  35.1 
 
 		 177 aa  114  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  39.47 
 
 		 158 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  42.66 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  41.18 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  44.62 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  38.13 
 
 		 176 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  39.07 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2639  glutathione peroxidase  39.47 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.833403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  40.37 
 
 		 158 aa  113  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  41.18 
 
 		 164 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1769  glutathione peroxidase  44.74 
 
 		 162 aa  113  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0182367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  38.13 
 
 		 183 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  37.89 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  44.62 
 
 		 205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  37.86 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  41.45 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  37.01 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  39.33 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  37.86 
 
 		 179 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0007  glutathione peroxidase  34.51 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1207  glutathione peroxidase  36.99 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.205921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  38.13 
 
 		 183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  39.22 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  37.86 
 
 		 230 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  37.86 
 
 		 230 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  46.04 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  43.88 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  36.36 
 
 		 160 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  41.09 
 
 		 184 aa  110  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  38.13 
 
 		 202 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  40.58 
 
 		 162 aa  110  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  43.85 
 
 		 162 aa  110  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2474  glutathione peroxidase, putative  38.3 
 
 		 180 aa  110  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>