More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0808 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1422  ATPase central domain-containing protein  92.73 
 
 		 715 aa  1223    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0808  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 715 aa  1403    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2041  hypothetical protein  86.47 
 
 		 284 aa  320  6e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5669  AAA ATPase central domain protein  38.88 
 
 		 699 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.658199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1816  ATPase central domain-containing protein  40.16 
 
 		 590 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4675  ATPase central domain-containing protein  39.29 
 
 		 720 aa  231  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1566  AAA ATPase central domain protein  33.18 
 
 		 625 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20815  hitchhiker  0.00245284 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1202  ATPase central domain-containing protein  38.35 
 
 		 627 aa  218  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0870142  normal  0.869838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0985  AAA ATPase central domain protein  38.68 
 
 		 683 aa  205  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3837  AAA ATPase central domain protein  37.85 
 
 		 715 aa  198  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0020  AAA ATPase, central region  31.69 
 
 		 697 aa  171  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.91 
 
 		 510 aa  169  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0194  AAA ATPase central domain protein  33.05 
 
 		 619 aa  167  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.46 
 
 		 760 aa  161  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1361  AAA ATPase, central region  30.39 
 
 		 704 aa  159  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252526  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.99 
 
 		 643 aa  160  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05588  intermembrane space AAA protease IAP-1 (AFU_orthologue; AFUA_4G11530)  31.7 
 
 		 784 aa  159  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.14 
 
 		 656 aa  157  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0660  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.24 
 
 		 620 aa  155  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464509  normal  0.415833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  31.99 
 
 		 783 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  31.75 
 
 		 784 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  31.99 
 
 		 783 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.75 
 
 		 781 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.52 
 
 		 667 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  31.99 
 
 		 760 aa  154  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.28 
 
 		 794 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.86 
 
 		 639 aa  152  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.1 
 
 		 793 aa  151  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1784  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.83 
 
 		 660 aa  151  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.26 
 
 		 642 aa  151  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.26 
 
 		 642 aa  151  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  32.31 
 
 		 640 aa  150  6e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.58 
 
 		 638 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  29.8 
 
 		 658 aa  150  7e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.02 
 
 		 643 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.26 
 
 		 642 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.63 
 
 		 743 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.57 
 
 		 638 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.15 
 
 		 801 aa  149  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.82 
 
 		 607 aa  148  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.35 
 
 		 638 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.57 
 
 		 638 aa  149  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.95 
 
 		 641 aa  148  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.43 
 
 		 625 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.82 
 
 		 638 aa  148  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38163  predicted protein  30.33 
 
 		 800 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.158186  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.04 
 
 		 640 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  30.94 
 
 		 673 aa  148  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  30.86 
 
 		 645 aa  147  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3656  AAA ATPase, central region  32.94 
 
 		 694 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.82 
 
 		 640 aa  147  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.96 
 
 		 611 aa  147  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.09 
 
 		 640 aa  147  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.92 
 
 		 601 aa  147  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.09 
 
 		 622 aa  146  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.18 
 
 		 646 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.77 
 
 		 640 aa  147  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.18 
 
 		 646 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.92 
 
 		 608 aa  146  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01970  ATP-dependent peptidase, putative  31.7 
 
 		 782 aa  145  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.98 
 
 		 651 aa  146  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  29.36 
 
 		 640 aa  145  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.99 
 
 		 640 aa  146  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.46 
 
 		 638 aa  146  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.68 
 
 		 601 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  30.05 
 
 		 798 aa  145  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.44 
 
 		 640 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  32.13 
 
 		 630 aa  145  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0873  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.1 
 
 		 645 aa  145  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  29.69 
 
 		 614 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.75 
 
 		 631 aa  144  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.97 
 
 		 636 aa  144  4e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.23 
 
 		 623 aa  144  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.62 
 
 		 669 aa  144  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.19 
 
 		 645 aa  144  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0566  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.76 
 
 		 633 aa  143  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.15 
 
 		 662 aa  143  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7198  Microtubule-severing ATPase  36.2 
 
 		 663 aa  143  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0849577  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.69 
 
 		 659 aa  143  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.614445 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0665  membrane protease FtsH catalytic subunit  29.95 
 
 		 633 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735845  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  32.79 
 
 		 704 aa  143  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.67 
 
 		 646 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  30.58 
 
 		 637 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2318  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.95 
 
 		 633 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0771513  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.4 
 
 		 626 aa  143  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0297  putative cell division protein  31.72 
 
 		 635 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.168134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6052  AAA ATPase central domain protein  30.77 
 
 		 634 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.248698 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16182  predicted protein  32.27 
 
 		 514 aa  142  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0647858  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1231  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.44 
 
 		 617 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.901618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0276  ATP-dependent Zn protease  33.94 
 
 		 708 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00629107  normal  0.162688 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.23 
 
 		 634 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.18 
 
 		 617 aa  141  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.91 
 
 		 643 aa  141  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2842  cell division protease ftsH  30.54 
 
 		 639 aa  142  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  30.54 
 
 		 639 aa  142  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.38 
 
 		 671 aa  141  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1990  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.42 
 
 		 659 aa  142  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.144891  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.22 
 
 		 618 aa  142  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4762  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.22 
 
 		 691 aa  142  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0811  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.26 
 
 		 663 aa  141  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.569146  hitchhiker  0.0043584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>