147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4139 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 211 aa  427  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 211 aa  427  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4802  DSBA oxidoreductase  67.46 
 
 		 212 aa  289  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  67.46 
 
 		 212 aa  288  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  67.46 
 
 		 212 aa  288  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  66.83 
 
 		 212 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  65.55 
 
 		 212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  66.51 
 
 		 212 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  64.11 
 
 		 212 aa  280  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2547  DSBA oxidoreductase  53.96 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.435599 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0733  DSBA oxidoreductase  52.97 
 
 		 212 aa  211  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0784409 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0716  DSBA oxidoreductase  52.97 
 
 		 212 aa  211  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.759492  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3929  DSBA oxidoreductase  53.47 
 
 		 212 aa  208  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0559828  normal  0.0117415 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2418  DSBA oxidoreductase  49.26 
 
 		 214 aa  207  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3882  putative isomerase  49.26 
 
 		 216 aa  204  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0353  DSBA oxidoreductase  53.47 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.824557  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0837  DSBA oxidoreductase  53.47 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0809  DSBA oxidoreductase  53.47 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3149  hypothetical protein  49.75 
 
 		 723 aa  198  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2031  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  49.75 
 
 		 212 aa  197  9e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231053  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3204  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  49.75 
 
 		 212 aa  197  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0883  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  49.75 
 
 		 212 aa  197  9e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2717  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  49.75 
 
 		 212 aa  197  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3188  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  49.75 
 
 		 212 aa  197  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1893  thioredoxin domain-containing protein  49.75 
 
 		 212 aa  197  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389151  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  48.77 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0797  DSBA oxidoreductase  46.8 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  48.57 
 
 		 210 aa  192  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  39.79 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3351  putative isomerase  37.96 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0479  DSBA oxidoreductase  38.32 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4346  DSBA oxidoreductase  38.1 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0747  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.340191  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4707  DSBA oxidoreductase  37.69 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4153  DSBA oxidoreductase  36.92 
 
 		 217 aa  121  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3753  DSBA oxidoreductase  35.51 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.819118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3034  DSBA oxidoreductase  35.51 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5961  DSBA oxidoreductase  35.2 
 
 		 211 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0517  DSBA oxidoreductase  35.24 
 
 		 218 aa  104  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 		 197 aa  99.8  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  34.21 
 
 		 224 aa  98.6  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  31.02 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  30.15 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  32.97 
 
 		 201 aa  89.4  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  32.35 
 
 		 204 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  30.32 
 
 		 205 aa  88.2  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 		 204 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  30.43 
 
 		 195 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  32.66 
 
 		 209 aa  85.5  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 		 195 aa  85.5  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  31.4 
 
 		 201 aa  84.7  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 		 197 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  26.53 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  29.89 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  32.47 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  29.03 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  31.96 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  29.26 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  27.41 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  28.14 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  28.14 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  27.69 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  30.93 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  32.45 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  26.94 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  32.82 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  25.87 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  27.64 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4348  DSBA oxidoreductase  30.85 
 
 		 198 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  27.96 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  28.22 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5568  DSBA oxidoreductase  28.78 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  30.1 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  29.89 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  31.02 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  28.96 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  30.39 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  28.87 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  28.34 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  30.69 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  26.78 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  27.67 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  29.35 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>