242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3623 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3623  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  328  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  71.25 
 
 		 178 aa  209  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  30.41 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  30.41 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  30.41 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  30.41 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  30.41 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  30.41 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  30.41 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  30.41 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  31.16 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  30.41 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  29.17 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  28.87 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  28.87 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  28.87 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  28.87 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  29.37 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  31.9 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  33.02 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  33.02 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  33.02 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  30.77 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  30.77 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  31.36 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2359  MarR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.534803 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  29.51 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 147 aa  51.6  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 185 aa  51.6  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  32.06 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 212 aa  50.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 212 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  36.27 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3146  MarR family protein  31.33 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0536373 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  28.48 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  40.96 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01154  transcriptional regulator MarR family  34.34 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.819197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 148 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  25.76 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  29.67 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4886  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0545519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 139 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  47.4  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  26.45 
 
 		 139 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0548  MarR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  25.17 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 303 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  26.45 
 
 		 139 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 139 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  35.63 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  26.45 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  25.62 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  26.67 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  24.62 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  35.21 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  21.24 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>