More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0215 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 313 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  85.15 
 
 		 306 aa  522  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  78.47 
 
 		 277 aa  443  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  83.14 
 
 		 260 aa  440  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  79.09 
 
 		 274 aa  437  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  77.91 
 
 		 261 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  76.86 
 
 		 260 aa  413  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  76.47 
 
 		 261 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  73.78 
 
 		 279 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  76.86 
 
 		 260 aa  408  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  76.86 
 
 		 264 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  74.81 
 
 		 272 aa  404  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  73.48 
 
 		 274 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  75.29 
 
 		 274 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  75.19 
 
 		 261 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  76.86 
 
 		 261 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  76.47 
 
 		 261 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  74.81 
 
 		 263 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  73.64 
 
 		 269 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  70.52 
 
 		 273 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  69.89 
 
 		 272 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  76.75 
 
 		 255 aa  368  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  69.48 
 
 		 286 aa  360  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  68 
 
 		 277 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  67.46 
 
 		 265 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  67.6 
 
 		 277 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  63.75 
 
 		 269 aa  330  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.2 
 
 		 264 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  62.15 
 
 		 269 aa  323  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  64.68 
 
 		 260 aa  322  5e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  61.9 
 
 		 270 aa  320  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  64.26 
 
 		 260 aa  315  6e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  58.47 
 
 		 296 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  58.47 
 
 		 275 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  58.47 
 
 		 282 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  59.6 
 
 		 280 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  59.2 
 
 		 266 aa  307  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 273 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  58.63 
 
 		 269 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  59.2 
 
 		 269 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  60.31 
 
 		 262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58 
 
 		 269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  57.77 
 
 		 277 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  56.75 
 
 		 276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  58.23 
 
 		 269 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  58.33 
 
 		 265 aa  299  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  58.33 
 
 		 265 aa  300  3e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  53.03 
 
 		 276 aa  296  2e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  53.64 
 
 		 276 aa  295  9e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  56.8 
 
 		 274 aa  293  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.65 
 
 		 270 aa  290  1e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.73 
 
 		 266 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  58.33 
 
 		 256 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  55.29 
 
 		 256 aa  288  9e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  55.69 
 
 		 256 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  58.17 
 
 		 278 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  53.78 
 
 		 289 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  55.51 
 
 		 289 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3873  ABC transporter related  57.87 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0725392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  55.6 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  52.17 
 
 		 261 aa  278  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1542  ABC transporter related protein  54.98 
 
 		 255 aa  278  9e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.76 
 
 		 256 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3008  ABC transporter-related protein  54.76 
 
 		 275 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00336682  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  54.58 
 
 		 296 aa  268  5.9999999999999995e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  53.78 
 
 		 255 aa  268  8.999999999999999e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7156  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  50.2 
 
 		 264 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  48.2 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  53.82 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  49.4 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4298  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.64 
 
 		 305 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  hitchhiker  0.00350718 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  49 
 
 		 250 aa  255  8e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  45.78 
 
 		 253 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  49.22 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  48.45 
 
 		 285 aa  246  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  48.79 
 
 		 292 aa  242  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  48.59 
 
 		 273 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  46.18 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  48.4 
 
 		 268 aa  239  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1438  ABC transporter related  49.26 
 
 		 310 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409389  hitchhiker  0.00000418659 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3501  ABC transporter related  46.46 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  48 
 
 		 274 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  44.62 
 
 		 275 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  47.6 
 
 		 271 aa  235  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  46.4 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  46.03 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  44.58 
 
 		 264 aa  228  7e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  46.4 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1001  ABC transporter related  46.61 
 
 		 268 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  42.91 
 
 		 261 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  44.58 
 
 		 265 aa  227  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4818  ABC transporter related  45.6 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0483  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  44.23 
 
 		 261 aa  226  3e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  48 
 
 		 261 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  45.2 
 
 		 612 aa  226  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  45.06 
 
 		 255 aa  225  8e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  42.17 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  43.6 
 
 		 265 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  45.6 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  45.42 
 
 		 256 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>