99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6497 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6497  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
234 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121747  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2974  hydrolase  44.49 
 
 
241 aa  191  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.784052  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1975  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.95 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000211105 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  22.6 
 
 
224 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  23.71 
 
 
221 aa  55.5  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  27.4 
 
 
224 aa  53.5  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  24.63 
 
 
233 aa  52.4  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  23.04 
 
 
227 aa  52.8  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  24.64 
 
 
224 aa  52.4  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  23.08 
 
 
224 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  23.23 
 
 
231 aa  52  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3213  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.92 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  24.75 
 
 
211 aa  51.6  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  23.86 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  21.67 
 
 
223 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.56 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  22.49 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  23.67 
 
 
223 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  24.14 
 
 
245 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  29.74 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.67 
 
 
217 aa  49.7  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  26.83 
 
 
225 aa  49.7  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  25.24 
 
 
232 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.01 
 
 
222 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  22.6 
 
 
224 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  24.88 
 
 
232 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.91 
 
 
221 aa  48.5  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.11 
 
 
254 aa  48.5  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0128  phosphoglycolate phosphatase  26.74 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  26.26 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  26 
 
 
272 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3819  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.52 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  26.5 
 
 
272 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  31.63 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  27.69 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  25.38 
 
 
272 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.96 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  26.09 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  24.12 
 
 
225 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  25.38 
 
 
272 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0639  HAD family hydrolase  28.04 
 
 
239 aa  46.2  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0512419 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0122  haloacid dehalogenase-like hydrolase  22.97 
 
 
236 aa  46.2  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.817509  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  27.75 
 
 
226 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  37.11 
 
 
230 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  24.88 
 
 
226 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  28.5 
 
 
220 aa  45.8  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  37.11 
 
 
230 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.09 
 
 
236 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 
223 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.2 
 
 
222 aa  45.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0129  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.92 
 
 
543 aa  45.8  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  27.04 
 
 
272 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  26.44 
 
 
225 aa  45.4  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  27.04 
 
 
272 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  20.1 
 
 
229 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.63 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06050  hypothetical protein  27.55 
 
 
220 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  25.77 
 
 
128 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  26.13 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  23.86 
 
 
272 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  23.33 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0922  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.27 
 
 
219 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  29.81 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  25.98 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.08 
 
 
207 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  26.4 
 
 
216 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.58 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2329  HAD-superfamily hydrolase  28.29 
 
 
217 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.480139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.67 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  32.05 
 
 
234 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.62 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  29.13 
 
 
234 aa  43.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  24.27 
 
 
233 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  28.71 
 
 
219 aa  43.5  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  27.69 
 
 
221 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.26 
 
 
219 aa  43.5  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  24.18 
 
 
225 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0233  HAD family hydrolase  40 
 
 
279 aa  43.5  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  23.22 
 
 
249 aa  43.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.16 
 
 
238 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0040  HAD family hydrolase  40 
 
 
267 aa  43.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00579975  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  23.38 
 
 
219 aa  43.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  22 
 
 
234 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  29.59 
 
 
229 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  25.26 
 
 
226 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2746  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
226 aa  42.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.20923  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  25.12 
 
 
261 aa  42.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  26.21 
 
 
231 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1790  HAD family hydrolase  39.58 
 
 
277 aa  42.4  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  26.21 
 
 
231 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  27.69 
 
 
213 aa  42.4  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  25.39 
 
 
223 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.28 
 
 
200 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  34.04 
 
 
219 aa  42  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  26.46 
 
 
233 aa  42  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  23.71 
 
 
234 aa  42  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  31.87 
 
 
258 aa  42  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  23.41 
 
 
209 aa  42  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.041002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>