More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2577 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 237 aa  473  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  75.97 
 
 		 236 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  75.32 
 
 		 235 aa  358  4e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  71.31 
 
 		 241 aa  355  2.9999999999999997e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  75.32 
 
 		 236 aa  354  5e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  72.03 
 
 		 237 aa  351  5e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  71.55 
 
 		 264 aa  347  7e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  72.53 
 
 		 237 aa  347  9e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  70.76 
 
 		 237 aa  337  8e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3159  phosphoserine phosphatase  74.46 
 
 		 238 aa  324  7e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2506  phosphoserine phosphatase SerB  74.46 
 
 		 238 aa  324  7e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  63.43 
 
 		 279 aa  264  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  64.35 
 
 		 279 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  62.5 
 
 		 279 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  60.37 
 
 		 281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  61.11 
 
 		 281 aa  252  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  61.11 
 
 		 281 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  61.11 
 
 		 281 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  61.11 
 
 		 281 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  61.11 
 
 		 281 aa  252  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  61.11 
 
 		 454 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  60.47 
 
 		 281 aa  251  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  61.11 
 
 		 568 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  59.91 
 
 		 281 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  59.91 
 
 		 316 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  59.91 
 
 		 316 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  60.65 
 
 		 281 aa  249  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  60.93 
 
 		 316 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  60.93 
 
 		 281 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  59.72 
 
 		 284 aa  246  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  57.87 
 
 		 307 aa  241  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  58.14 
 
 		 285 aa  239  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  54.04 
 
 		 275 aa  234  7e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  57.14 
 
 		 279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  57.67 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  57.21 
 
 		 310 aa  231  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  55.56 
 
 		 281 aa  229  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0913  phosphoserine phosphatase SerB  56.11 
 
 		 296 aa  229  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.697374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  56.56 
 
 		 296 aa  228  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  52.97 
 
 		 276 aa  220  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  53.24 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  50.22 
 
 		 280 aa  205  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  47.39 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  50.71 
 
 		 404 aa  192  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  51.9 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  51.43 
 
 		 298 aa  191  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  51.67 
 
 		 289 aa  191  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  51.9 
 
 		 298 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  50.48 
 
 		 326 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  48.82 
 
 		 410 aa  186  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  50.24 
 
 		 411 aa  185  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  47.87 
 
 		 398 aa  185  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  49.76 
 
 		 404 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  50 
 
 		 326 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  49.04 
 
 		 292 aa  181  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  47.87 
 
 		 408 aa  181  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  48.34 
 
 		 410 aa  181  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  47.39 
 
 		 398 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  50.25 
 
 		 328 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  47.87 
 
 		 405 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  48.4 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  49.05 
 
 		 295 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  49.76 
 
 		 404 aa  178  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  49.76 
 
 		 419 aa  178  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  46.92 
 
 		 410 aa  178  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  46.92 
 
 		 438 aa  177  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  48.84 
 
 		 372 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  46.43 
 
 		 322 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  48 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  48.84 
 
 		 327 aa  176  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  50.25 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  50.25 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  46.45 
 
 		 413 aa  176  3e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  49.76 
 
 		 404 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  50.25 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  50.25 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  50.25 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  50.25 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  50.25 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  50.25 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  48.1 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  45.61 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  48 
 
 		 296 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  49.75 
 
 		 325 aa  175  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  49.75 
 
 		 322 aa  174  9e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  48.77 
 
 		 322 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  48.77 
 
 		 322 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  48.77 
 
 		 322 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  49.05 
 
 		 298 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  48.77 
 
 		 322 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  48.77 
 
 		 322 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  48.1 
 
 		 325 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  47.39 
 
 		 412 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  48.34 
 
 		 325 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  46.98 
 
 		 400 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  49.29 
 
 		 404 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  49.29 
 
 		 415 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  48.82 
 
 		 404 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  46.92 
 
 		 405 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>