More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2506 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3159  phosphoserine phosphatase  100 
 
 
238 aa  477  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2506  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
238 aa  477  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  86.64 
 
 
237 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  81.82 
 
 
264 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  73.5 
 
 
236 aa  353  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  72.65 
 
 
237 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  74.25 
 
 
235 aa  350  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  73.11 
 
 
241 aa  348  6e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  70.64 
 
 
236 aa  341  5e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  74.55 
 
 
237 aa  337  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  69.83 
 
 
237 aa  336  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  58.8 
 
 
279 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  58.33 
 
 
279 aa  241  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  57.41 
 
 
279 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  56.94 
 
 
284 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  56.48 
 
 
454 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  56.48 
 
 
281 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  56.48 
 
 
281 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  56.48 
 
 
281 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  56.48 
 
 
281 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  56.48 
 
 
281 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  56.48 
 
 
568 aa  234  8e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  56.81 
 
 
307 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  56.02 
 
 
281 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  57.41 
 
 
279 aa  231  9e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  54.84 
 
 
281 aa  228  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  53.74 
 
 
316 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  53.74 
 
 
316 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  55.81 
 
 
281 aa  228  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  55.81 
 
 
316 aa  228  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  54.84 
 
 
281 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  56.54 
 
 
275 aa  226  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  54.88 
 
 
281 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  53.49 
 
 
285 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  50.9 
 
 
276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  53.02 
 
 
285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0913  phosphoserine phosphatase SerB  55.02 
 
 
296 aa  214  7e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.697374  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  52.56 
 
 
310 aa  214  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  55.12 
 
 
296 aa  214  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  51.39 
 
 
281 aa  208  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  51.64 
 
 
302 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  52.86 
 
 
326 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  51.9 
 
 
326 aa  189  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  49.29 
 
 
398 aa  187  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  46.92 
 
 
278 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  50.73 
 
 
408 aa  185  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  49.77 
 
 
404 aa  184  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
404 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  49.26 
 
 
280 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  46.92 
 
 
410 aa  180  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  50.24 
 
 
411 aa  180  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  47.42 
 
 
438 aa  178  5.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  46.95 
 
 
405 aa  175  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  48.61 
 
 
357 aa  174  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  46.48 
 
 
405 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  47.39 
 
 
405 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  47.42 
 
 
410 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  46.92 
 
 
405 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  47.44 
 
 
372 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  46.48 
 
 
410 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  47.44 
 
 
327 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  48.77 
 
 
328 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  46.45 
 
 
398 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  47.42 
 
 
429 aa  172  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  45.97 
 
 
413 aa  172  5.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  50.24 
 
 
419 aa  171  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  47.12 
 
 
298 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  48.82 
 
 
404 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  47.09 
 
 
297 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  46.15 
 
 
298 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  45.67 
 
 
298 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  45.97 
 
 
412 aa  170  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  47.42 
 
 
404 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  48.08 
 
 
292 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  47.42 
 
 
429 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  47.12 
 
 
322 aa  169  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  45.29 
 
 
296 aa  168  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  46.95 
 
 
404 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  47.44 
 
 
400 aa  168  7e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1310  phosphoserine phosphatase SerB  45.41 
 
 
303 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193327  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  47.89 
 
 
415 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  45.07 
 
 
406 aa  166  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  47.3 
 
 
297 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  47.89 
 
 
404 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  46.95 
 
 
404 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  47.62 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  46.98 
 
 
400 aa  166  4e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  47.17 
 
 
435 aa  166  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  44.02 
 
 
327 aa  166  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  47.14 
 
 
296 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  45.97 
 
 
418 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  48.08 
 
 
226 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  45.5 
 
 
418 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  44.89 
 
 
309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  45.5 
 
 
326 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  46.63 
 
 
298 aa  161  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  43.98 
 
 
317 aa  161  7e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  47.62 
 
 
432 aa  160  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  45.5 
 
 
326 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  45.5 
 
 
326 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>