More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1712 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
410 aa  831    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  58.69 
 
 
408 aa  490  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  58.56 
 
 
413 aa  488  1e-136  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  57.68 
 
 
404 aa  481  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  56.14 
 
 
411 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  56.39 
 
 
429 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  56.89 
 
 
404 aa  461  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  56.39 
 
 
404 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  54.73 
 
 
405 aa  461  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  56.39 
 
 
429 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  55.64 
 
 
404 aa  451  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  56.25 
 
 
412 aa  448  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  55.39 
 
 
418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  55.39 
 
 
418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  55.28 
 
 
405 aa  443  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  53.37 
 
 
406 aa  441  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  53.88 
 
 
404 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  54.25 
 
 
410 aa  441  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  54.77 
 
 
405 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  54.41 
 
 
410 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  54.52 
 
 
405 aa  437  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  50.61 
 
 
438 aa  433  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  51.63 
 
 
404 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
398 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  50.38 
 
 
415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  50.38 
 
 
404 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  50.13 
 
 
404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  44.67 
 
 
411 aa  330  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  42.82 
 
 
398 aa  317  3e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  40.7 
 
 
406 aa  274  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  40.1 
 
 
432 aa  271  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  39.29 
 
 
407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  37.47 
 
 
419 aa  260  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  37.63 
 
 
403 aa  253  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  38.33 
 
 
429 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  36.62 
 
 
414 aa  247  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1310  phosphoserine phosphatase SerB  47.92 
 
 
303 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193327  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  39 
 
 
406 aa  245  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  37.53 
 
 
409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  37.17 
 
 
419 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  36.73 
 
 
409 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  37.84 
 
 
420 aa  243  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  38 
 
 
421 aa  240  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  53.81 
 
 
400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  53.33 
 
 
400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  37.43 
 
 
380 aa  232  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  52.38 
 
 
435 aa  226  4e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2083  phosphoserine phosphatase SerB  36.59 
 
 
419 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726973  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  36.34 
 
 
410 aa  221  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  35.34 
 
 
410 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1834  phosphoserine phosphatase SerB  35.78 
 
 
417 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0739277  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1853  phosphoserine phosphatase SerB  35.78 
 
 
417 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  33.76 
 
 
400 aa  218  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1900  phosphoserine phosphatase SerB  35.78 
 
 
417 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  39.8 
 
 
306 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  39.8 
 
 
306 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  52.86 
 
 
281 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  48.93 
 
 
322 aa  216  7e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  51.47 
 
 
326 aa  215  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  46.78 
 
 
326 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  47.21 
 
 
322 aa  212  9e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  47.21 
 
 
322 aa  212  9e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  47.21 
 
 
322 aa  212  9e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  47.21 
 
 
322 aa  212  9e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  47.21 
 
 
322 aa  212  9e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  47.21 
 
 
322 aa  212  9e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  47.21 
 
 
322 aa  212  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  47.21 
 
 
322 aa  212  9e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  46.78 
 
 
322 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  52.4 
 
 
325 aa  210  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  44.17 
 
 
325 aa  209  6e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  44.87 
 
 
325 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  52.4 
 
 
326 aa  208  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  52.4 
 
 
326 aa  208  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  43.75 
 
 
325 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  44.64 
 
 
328 aa  207  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  52.4 
 
 
326 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  39.04 
 
 
317 aa  207  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  48.89 
 
 
281 aa  207  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  48.65 
 
 
279 aa  206  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  51.96 
 
 
322 aa  206  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  45.06 
 
 
322 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  45.06 
 
 
322 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  45.06 
 
 
322 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  45.06 
 
 
322 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  45.06 
 
 
322 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  43.4 
 
 
302 aa  203  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  48.89 
 
 
279 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  49.27 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  47.11 
 
 
281 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  49.27 
 
 
357 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  44.21 
 
 
325 aa  199  7.999999999999999e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  47.11 
 
 
281 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  47.11 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  47.11 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  46.05 
 
 
310 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  48 
 
 
279 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  47.11 
 
 
281 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  44.96 
 
 
369 aa  197  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  47.3 
 
 
279 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>