More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0990 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 406 aa  779    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  76.17 
 
 		 409 aa  606  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  70.18 
 
 		 414 aa  525  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  67.09 
 
 		 421 aa  483  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  65.92 
 
 		 409 aa  484  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1834  phosphoserine phosphatase SerB  66.25 
 
 		 417 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0739277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1853  phosphoserine phosphatase SerB  66.25 
 
 		 417 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1900  phosphoserine phosphatase SerB  66.25 
 
 		 417 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  64.18 
 
 		 410 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  65.62 
 
 		 380 aa  436  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2083  phosphoserine phosphatase SerB  65 
 
 		 419 aa  436  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  58.17 
 
 		 407 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  57.43 
 
 		 406 aa  402  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  55.35 
 
 		 420 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  50.12 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  57.39 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  55.14 
 
 		 403 aa  363  4e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  52.37 
 
 		 432 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  56.4 
 
 		 419 aa  355  1e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  60.87 
 
 		 306 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  60.87 
 
 		 306 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  52.84 
 
 		 410 aa  331  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  41.56 
 
 		 405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  43.37 
 
 		 418 aa  275  8e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  43 
 
 		 418 aa  273  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  40.15 
 
 		 408 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  41.16 
 
 		 406 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  41.62 
 
 		 429 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  39.9 
 
 		 410 aa  265  8.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  42.64 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  42.24 
 
 		 429 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  42.35 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  39.29 
 
 		 410 aa  263  3e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  41.56 
 
 		 415 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  40.74 
 
 		 404 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  40.99 
 
 		 404 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  40.55 
 
 		 398 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  39.26 
 
 		 412 aa  259  6e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  38.9 
 
 		 410 aa  258  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  38.05 
 
 		 413 aa  258  2e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  40.2 
 
 		 404 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  40.4 
 
 		 411 aa  256  7e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  39.95 
 
 		 404 aa  255  9e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  39.35 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  39.65 
 
 		 404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  40.1 
 
 		 405 aa  248  1e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  39.55 
 
 		 405 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  40.66 
 
 		 404 aa  245  9e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  39.85 
 
 		 405 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  35.99 
 
 		 398 aa  237  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  50.37 
 
 		 297 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2123  phosphoserine phosphatase  47.25 
 
 		 297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0782028  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  38.13 
 
 		 411 aa  219  5e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  36.12 
 
 		 400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  54.85 
 
 		 223 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  42.86 
 
 		 296 aa  200  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1689  phosphoserine phosphatase SerB  56.86 
 
 		 216 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  46.43 
 
 		 435 aa  194  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  44.98 
 
 		 284 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1168  phosphoserine phosphatase SerB  52.24 
 
 		 213 aa  192  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.748705 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  49.35 
 
 		 281 aa  192  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  48.74 
 
 		 281 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  44.22 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  48.32 
 
 		 279 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  43.77 
 
 		 285 aa  190  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  47.21 
 
 		 325 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21750  phosphoserine phosphatase SerB  55.83 
 
 		 234 aa  189  8e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.875318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  46.61 
 
 		 400 aa  189  8e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1969  phosphoserine phosphatase  49.57 
 
 		 240 aa  186  5e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  46.35 
 
 		 325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1478  phosphoserine phosphatase  47.57 
 
 		 215 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15880  phosphoserine phosphatase SerB  51.46 
 
 		 225 aa  184  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0152632  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  41.95 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  48.78 
 
 		 302 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11600  phosphoserine phosphatase SerB  52.48 
 
 		 278 aa  183  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  43.13 
 
 		 322 aa  183  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  43.13 
 
 		 322 aa  183  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  43.13 
 
 		 322 aa  183  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  43.13 
 
 		 322 aa  183  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  43.13 
 
 		 322 aa  183  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  43.13 
 
 		 322 aa  183  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  43.13 
 
 		 322 aa  183  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  43.13 
 
 		 322 aa  183  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  50 
 
 		 279 aa  182  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  49.32 
 
 		 281 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  46.64 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  46.64 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  42.75 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  45.69 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  40.69 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  45.83 
 
 		 279 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  45.92 
 
 		 325 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  40.69 
 
 		 326 aa  180  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  46.22 
 
 		 310 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  40.69 
 
 		 326 aa  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  45.8 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  46.22 
 
 		 281 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  42.75 
 
 		 322 aa  179  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  37.5 
 
 		 326 aa  179  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  43.13 
 
 		 322 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>