More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1350 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
419 aa  801    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  57.89 
 
 
407 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  55.69 
 
 
409 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  55.53 
 
 
414 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  56.19 
 
 
406 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  53 
 
 
419 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  55.42 
 
 
421 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  53.43 
 
 
420 aa  372  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  52.48 
 
 
432 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  53.43 
 
 
409 aa  371  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  56.88 
 
 
380 aa  371  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  56.4 
 
 
406 aa  368  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  55.11 
 
 
403 aa  363  3e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  58.19 
 
 
429 aa  358  9e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1834  phosphoserine phosphatase SerB  52.77 
 
 
417 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0739277  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1853  phosphoserine phosphatase SerB  52.77 
 
 
417 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1900  phosphoserine phosphatase SerB  52.77 
 
 
417 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  52.23 
 
 
410 aa  335  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  51.73 
 
 
410 aa  324  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2083  phosphoserine phosphatase SerB  50.71 
 
 
419 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726973  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  51.52 
 
 
306 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  51.52 
 
 
306 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  41.83 
 
 
411 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  42.12 
 
 
404 aa  266  7e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  40.1 
 
 
412 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  41.79 
 
 
405 aa  263  6e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  38.81 
 
 
413 aa  259  7e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  41.52 
 
 
418 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  38.89 
 
 
410 aa  258  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  40.59 
 
 
404 aa  256  4e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  41.03 
 
 
406 aa  256  6e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  37.41 
 
 
410 aa  256  6e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  40.05 
 
 
398 aa  255  9e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  41.48 
 
 
418 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  39.51 
 
 
410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  41.44 
 
 
404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  39.51 
 
 
408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  39.95 
 
 
405 aa  252  9.000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  39.34 
 
 
438 aa  251  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  41.44 
 
 
404 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  39.95 
 
 
405 aa  250  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  39.47 
 
 
405 aa  249  7e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  41.19 
 
 
429 aa  249  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  40 
 
 
404 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  39.52 
 
 
415 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  40 
 
 
404 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  40 
 
 
429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  39.9 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  41.48 
 
 
404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  38.02 
 
 
404 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  51.16 
 
 
297 aa  230  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2123  phosphoserine phosphatase  46.55 
 
 
297 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0782028  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  36.55 
 
 
400 aa  216  5e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  40.62 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1969  phosphoserine phosphatase  54.41 
 
 
240 aa  206  5e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  54.85 
 
 
223 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21750  phosphoserine phosphatase SerB  53.7 
 
 
234 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.875318  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  47.96 
 
 
400 aa  195  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  51.56 
 
 
328 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  44.84 
 
 
306 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  47.51 
 
 
400 aa  189  5e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  47.23 
 
 
284 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  41.53 
 
 
296 aa  190  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1168  phosphoserine phosphatase SerB  51.23 
 
 
213 aa  188  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.748705 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  49.51 
 
 
326 aa  189  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  41.44 
 
 
357 aa  187  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11600  phosphoserine phosphatase SerB  52.97 
 
 
278 aa  187  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  42.97 
 
 
369 aa  187  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  48.08 
 
 
322 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  48.08 
 
 
322 aa  187  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  48.08 
 
 
322 aa  187  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  48.08 
 
 
322 aa  187  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  48.08 
 
 
322 aa  187  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  48.08 
 
 
322 aa  187  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  48.08 
 
 
322 aa  187  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  48.08 
 
 
322 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  37.46 
 
 
327 aa  186  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  48.08 
 
 
322 aa  186  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1478  phosphoserine phosphatase  49.03 
 
 
215 aa  186  8e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1689  phosphoserine phosphatase SerB  54.07 
 
 
216 aa  186  9e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  43.14 
 
 
326 aa  186  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  49.27 
 
 
279 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2319  phosphoserine phosphatase SerB  57.49 
 
 
213 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  46.38 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  47.2 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  47.2 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  47.2 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  47.2 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  48.44 
 
 
322 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  47.2 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  44.92 
 
 
302 aa  184  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  49.52 
 
 
281 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  47.55 
 
 
322 aa  184  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  43.55 
 
 
435 aa  182  8.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  48.08 
 
 
326 aa  182  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  48.08 
 
 
326 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  48.08 
 
 
326 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  47.44 
 
 
325 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0625  phosphoserine phosphatase SerB  47.09 
 
 
213 aa  181  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0155366  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  39.58 
 
 
317 aa  181  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>