More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6301 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
316 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
316 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  92.09 
 
 
316 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  99.64 
 
 
281 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  96.8 
 
 
281 aa  550  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  94.66 
 
 
281 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  90.75 
 
 
281 aa  512  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  80.43 
 
 
454 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  80.43 
 
 
568 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  80.43 
 
 
281 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  80.43 
 
 
281 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  80.43 
 
 
281 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  80.43 
 
 
281 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  80.43 
 
 
281 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  80.07 
 
 
281 aa  461  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  80.58 
 
 
279 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  78.78 
 
 
279 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  79.14 
 
 
279 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  63.03 
 
 
284 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  63.29 
 
 
307 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  59.8 
 
 
310 aa  335  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  71.79 
 
 
285 aa  333  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  62.14 
 
 
285 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  55.76 
 
 
276 aa  296  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  56.65 
 
 
281 aa  278  6e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  53.76 
 
 
302 aa  265  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  60.83 
 
 
235 aa  259  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0913  phosphoserine phosphatase SerB  54.23 
 
 
296 aa  256  4e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.697374  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  60.18 
 
 
296 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  59.46 
 
 
279 aa  249  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  57.14 
 
 
241 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  57.41 
 
 
236 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  60.68 
 
 
237 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  56.68 
 
 
237 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  57.14 
 
 
236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  54.55 
 
 
275 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  53.19 
 
 
237 aa  229  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  52.94 
 
 
237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  44.94 
 
 
278 aa  220  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  51.15 
 
 
264 aa  219  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2506  phosphoserine phosphatase SerB  53.74 
 
 
238 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3159  phosphoserine phosphatase  53.74 
 
 
238 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  48.39 
 
 
418 aa  205  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  48.39 
 
 
418 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  51.43 
 
 
327 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  51.47 
 
 
326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  48.2 
 
 
410 aa  200  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  48.33 
 
 
404 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  49.55 
 
 
412 aa  199  7e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  47.11 
 
 
410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  47.98 
 
 
429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  47.18 
 
 
404 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  48.44 
 
 
438 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  45.73 
 
 
410 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  48.07 
 
 
408 aa  196  6e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  43.25 
 
 
415 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  43.25 
 
 
404 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  43.15 
 
 
405 aa  195  9e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  48.33 
 
 
404 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  44.54 
 
 
369 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  47.18 
 
 
404 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  46.77 
 
 
429 aa  192  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  40.26 
 
 
405 aa  192  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  42.81 
 
 
405 aa  191  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  42.81 
 
 
405 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  47.35 
 
 
435 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  46.58 
 
 
326 aa  189  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  45.65 
 
 
280 aa  188  8e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  46.77 
 
 
404 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  46.5 
 
 
406 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  46.22 
 
 
406 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  49.03 
 
 
398 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  50.49 
 
 
325 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  52.94 
 
 
372 aa  186  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  47.95 
 
 
328 aa  186  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  49.26 
 
 
289 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  52.94 
 
 
327 aa  186  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  49.75 
 
 
292 aa  186  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  47.77 
 
 
411 aa  185  7e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  47.01 
 
 
432 aa  185  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  50.23 
 
 
419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  49.51 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  44.58 
 
 
404 aa  183  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  51.22 
 
 
296 aa  182  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  42.74 
 
 
322 aa  181  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  47.95 
 
 
404 aa  179  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  48.53 
 
 
325 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  50.47 
 
 
406 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  46.88 
 
 
411 aa  179  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  46.86 
 
 
398 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  48.53 
 
 
322 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  48.53 
 
 
322 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  48.53 
 
 
322 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  48.53 
 
 
322 aa  178  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  48.53 
 
 
322 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  50.49 
 
 
407 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  48.53 
 
 
322 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  48.53 
 
 
322 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  48.53 
 
 
322 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  45.24 
 
 
420 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>