275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1278 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
357 aa  725    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  61.88 
 
 
306 aa  273  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  49.04 
 
 
322 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  49.04 
 
 
322 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  49.04 
 
 
322 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  49.04 
 
 
322 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  49.04 
 
 
322 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  47.77 
 
 
326 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  47.77 
 
 
326 aa  270  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  47.77 
 
 
326 aa  270  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  56.36 
 
 
325 aa  268  8e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  51.28 
 
 
325 aa  267  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  51.65 
 
 
325 aa  267  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  58.52 
 
 
325 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  57.39 
 
 
322 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  57.39 
 
 
322 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  57.39 
 
 
322 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  57.39 
 
 
322 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  57.39 
 
 
322 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  57.39 
 
 
322 aa  265  5.999999999999999e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  57.39 
 
 
322 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  57.39 
 
 
322 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  56.96 
 
 
326 aa  265  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  56.96 
 
 
322 aa  264  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  62.15 
 
 
328 aa  264  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  55.7 
 
 
326 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  54.24 
 
 
327 aa  262  6.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  50.94 
 
 
325 aa  256  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  53.91 
 
 
322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  52.32 
 
 
322 aa  252  6e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  54.47 
 
 
369 aa  249  5e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  53.07 
 
 
317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1046  phosphoserine phosphatase  47.83 
 
 
330 aa  229  8e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163618 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3361  phosphoserine phosphatase SerB  46.18 
 
 
326 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1007  phosphoserine phosphatase SerB  54.95 
 
 
328 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1107  phosphoserine phosphatase  47.46 
 
 
330 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829453 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1223  phosphoserine phosphatase  54.63 
 
 
330 aa  226  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1042  phosphoserine phosphatase  47.46 
 
 
330 aa  226  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3373  phosphoserine phosphatase  47.49 
 
 
330 aa  226  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.381097 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3222  phosphoserine phosphatase SerB  54.03 
 
 
326 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3043  phosphoserine phosphatase SerB  46.72 
 
 
335 aa  225  9e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3223  phosphoserine phosphatase SerB  45.82 
 
 
326 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3544  phosphoserine phosphatase SerB  50.21 
 
 
326 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0084049 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1145  phosphoserine phosphatase SerB  55.72 
 
 
326 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000532777 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2817  phosphoserine phosphatase SerB  51.36 
 
 
331 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1032  phosphoserine phosphatase SerB  54.46 
 
 
348 aa  223  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0978  phosphoserine phosphatase  47.64 
 
 
316 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  51.21 
 
 
398 aa  209  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2810  phosphoserine phosphatase SerB  56.45 
 
 
327 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  40.74 
 
 
404 aa  206  5e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  46.64 
 
 
432 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  49.27 
 
 
410 aa  200  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  44.07 
 
 
302 aa  197  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  45.15 
 
 
410 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  51.71 
 
 
404 aa  196  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  51.71 
 
 
411 aa  196  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  42.86 
 
 
413 aa  194  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  50.49 
 
 
275 aa  194  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  43.55 
 
 
411 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  49.27 
 
 
410 aa  193  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  48.29 
 
 
405 aa  193  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  50.24 
 
 
408 aa  192  5e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  51.71 
 
 
406 aa  192  8e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  49.76 
 
 
412 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  50.24 
 
 
407 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  45.76 
 
 
419 aa  189  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  49.76 
 
 
404 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  45.73 
 
 
279 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  46.81 
 
 
429 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  49.76 
 
 
404 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  45.69 
 
 
307 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  48.78 
 
 
438 aa  188  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  41.44 
 
 
419 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  51.22 
 
 
405 aa  187  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  49.52 
 
 
279 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  41.4 
 
 
429 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  50.73 
 
 
405 aa  186  6e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  44.49 
 
 
398 aa  185  8e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  45.26 
 
 
284 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  41.4 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1310  phosphoserine phosphatase SerB  42.04 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193327  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  38.65 
 
 
415 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  48.78 
 
 
404 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  38.65 
 
 
404 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  50.73 
 
 
405 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  48.78 
 
 
418 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  45.49 
 
 
241 aa  182  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  48.29 
 
 
418 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
264 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  40.7 
 
 
429 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  47.6 
 
 
281 aa  180  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  44.87 
 
 
279 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  44.44 
 
 
406 aa  180  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  40.69 
 
 
420 aa  180  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  48.28 
 
 
285 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  44.87 
 
 
279 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  45.09 
 
 
281 aa  179  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  47.32 
 
 
403 aa  179  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  42.31 
 
 
281 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  42.21 
 
 
281 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>