281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2446 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
369 aa  761    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  53.47 
 
 
325 aa  262  6e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  52.65 
 
 
325 aa  260  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  51.97 
 
 
325 aa  257  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  50.79 
 
 
322 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  50.79 
 
 
322 aa  257  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  50.79 
 
 
322 aa  257  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  50.79 
 
 
322 aa  257  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  50.79 
 
 
322 aa  257  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  50.79 
 
 
322 aa  257  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  50.79 
 
 
322 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  50.79 
 
 
322 aa  257  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  50.39 
 
 
322 aa  255  7e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  50.79 
 
 
322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  50.79 
 
 
322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  50.79 
 
 
322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  50.79 
 
 
322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  50.79 
 
 
322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  51.84 
 
 
325 aa  253  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  51.97 
 
 
325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  55.36 
 
 
328 aa  252  6e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  51.18 
 
 
322 aa  251  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  55.61 
 
 
322 aa  251  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  46.55 
 
 
326 aa  250  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  54.15 
 
 
327 aa  249  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  54.47 
 
 
357 aa  249  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  47.64 
 
 
306 aa  248  9e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  50 
 
 
326 aa  246  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  50 
 
 
326 aa  245  8e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  50 
 
 
326 aa  245  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  45.66 
 
 
326 aa  230  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  44.18 
 
 
317 aa  229  5e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1032  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
348 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1145  phosphoserine phosphatase SerB  47.86 
 
 
326 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000532777 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3222  phosphoserine phosphatase SerB  45.9 
 
 
326 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1007  phosphoserine phosphatase SerB  50.98 
 
 
328 aa  210  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3223  phosphoserine phosphatase SerB  45.34 
 
 
326 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3361  phosphoserine phosphatase SerB  47.21 
 
 
326 aa  206  8e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3373  phosphoserine phosphatase  44.92 
 
 
330 aa  205  9e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.381097 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2817  phosphoserine phosphatase SerB  47.49 
 
 
331 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1046  phosphoserine phosphatase  48.78 
 
 
330 aa  202  9e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163618 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1223  phosphoserine phosphatase  49.27 
 
 
330 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1042  phosphoserine phosphatase  48.29 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1107  phosphoserine phosphatase  48.29 
 
 
330 aa  200  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  46.32 
 
 
279 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  44.96 
 
 
281 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  45.3 
 
 
279 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3544  phosphoserine phosphatase SerB  46.92 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0084049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3043  phosphoserine phosphatase SerB  47.39 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  44.96 
 
 
410 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  44.96 
 
 
281 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0978  phosphoserine phosphatase  48.79 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  44.59 
 
 
279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  44.21 
 
 
285 aa  196  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  44.96 
 
 
316 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  49.75 
 
 
411 aa  195  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  46.32 
 
 
281 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  46.32 
 
 
281 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  44.54 
 
 
316 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  44.54 
 
 
316 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  46.32 
 
 
281 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  44.54 
 
 
281 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  46.32 
 
 
281 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  46.32 
 
 
281 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  46.32 
 
 
568 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  46.32 
 
 
454 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  47.16 
 
 
281 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  45.34 
 
 
302 aa  194  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2810  phosphoserine phosphatase SerB  48.04 
 
 
327 aa  192  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  43.8 
 
 
398 aa  192  9e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  51.24 
 
 
404 aa  192  9e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  42.13 
 
 
307 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  45.61 
 
 
281 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  45.04 
 
 
407 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  43.39 
 
 
285 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  41.61 
 
 
284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  49.26 
 
 
281 aa  189  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  42.98 
 
 
310 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  42.56 
 
 
405 aa  188  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  47.8 
 
 
419 aa  188  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  40.61 
 
 
404 aa  188  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  43.27 
 
 
413 aa  185  9e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  47.69 
 
 
278 aa  185  9e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1969  phosphoserine phosphatase  45.54 
 
 
240 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  43.07 
 
 
406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  42.19 
 
 
411 aa  184  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  48.76 
 
 
408 aa  181  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  42.68 
 
 
418 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2436  phosphoserine phosphatase SerB  38.57 
 
 
295 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  45.02 
 
 
279 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1310  phosphoserine phosphatase SerB  41.03 
 
 
303 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193327  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2388  phosphoserine phosphatase SerB  38.57 
 
 
295 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.361325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2343  phosphoserine phosphatase SerB  38.57 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843951  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2546  phosphoserine phosphatase SerB  38.57 
 
 
295 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0939603 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  41.32 
 
 
410 aa  180  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  43.46 
 
 
432 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  38.19 
 
 
276 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  45.27 
 
 
429 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  41.84 
 
 
418 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2432  phosphoserine phosphatase SerB  38.57 
 
 
295 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.190736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>