251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1007 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1007  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 328 aa  669    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1032  phosphoserine phosphatase SerB  61.09 
 
 		 348 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1145  phosphoserine phosphatase SerB  61.66 
 
 		 326 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000532777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3223  phosphoserine phosphatase SerB  60.74 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1223  phosphoserine phosphatase  58.79 
 
 		 330 aa  368  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3361  phosphoserine phosphatase SerB  60.43 
 
 		 326 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3222  phosphoserine phosphatase SerB  60.12 
 
 		 326 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1042  phosphoserine phosphatase  58.36 
 
 		 330 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1107  phosphoserine phosphatase  58.54 
 
 		 330 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829453 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1046  phosphoserine phosphatase  58.66 
 
 		 330 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163618 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2817  phosphoserine phosphatase SerB  58.73 
 
 		 331 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0978  phosphoserine phosphatase  58.94 
 
 		 316 aa  335  9e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2810  phosphoserine phosphatase SerB  57.23 
 
 		 327 aa  320  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3544  phosphoserine phosphatase SerB  56.76 
 
 		 326 aa  318  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084049 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3373  phosphoserine phosphatase  54.49 
 
 		 330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.381097 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3043  phosphoserine phosphatase SerB  52.05 
 
 		 335 aa  301  9e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  57.02 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  57.02 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  57.02 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  57.02 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  57.02 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  57.02 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  57.02 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  57.02 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  56.58 
 
 		 322 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  56.58 
 
 		 322 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  56.58 
 
 		 322 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  56.58 
 
 		 322 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  56.58 
 
 		 322 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  56.58 
 
 		 322 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  56.14 
 
 		 322 aa  245  8e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  56.42 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  56.14 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  54.82 
 
 		 325 aa  238  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  54.82 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  55.75 
 
 		 325 aa  236  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  57.89 
 
 		 325 aa  236  6e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  58.02 
 
 		 326 aa  235  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  57.55 
 
 		 326 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  57.55 
 
 		 326 aa  233  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  54.95 
 
 		 357 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  55.98 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  49.58 
 
 		 317 aa  225  1e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  54.21 
 
 		 328 aa  219  6e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  47.04 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  52.63 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  50.98 
 
 		 369 aa  210  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  49.01 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  48.04 
 
 		 413 aa  195  7e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  48.06 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  40.57 
 
 		 410 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  46.57 
 
 		 411 aa  186  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  42.32 
 
 		 302 aa  186  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  43.18 
 
 		 410 aa  185  9e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  48.06 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  41.96 
 
 		 410 aa  182  7e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  47.06 
 
 		 404 aa  182  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  44.14 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1969  phosphoserine phosphatase  49.5 
 
 		 240 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  41.77 
 
 		 408 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  42.92 
 
 		 415 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  42.92 
 
 		 404 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  40.87 
 
 		 405 aa  179  8e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  42.04 
 
 		 418 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  41.74 
 
 		 412 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  43.11 
 
 		 404 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  43.3 
 
 		 406 aa  177  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  42.98 
 
 		 404 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  48.06 
 
 		 419 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  42.98 
 
 		 429 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  42.73 
 
 		 418 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  44.12 
 
 		 404 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  45.1 
 
 		 398 aa  176  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  45.1 
 
 		 429 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  42.54 
 
 		 438 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  41.46 
 
 		 398 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  44.66 
 
 		 400 aa  172  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  45.15 
 
 		 432 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  41.23 
 
 		 404 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  46.15 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  44.78 
 
 		 414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  45.59 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  45.45 
 
 		 279 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  46.08 
 
 		 409 aa  166  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  46.57 
 
 		 406 aa  166  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  46.12 
 
 		 407 aa  165  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  43.13 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  44.5 
 
 		 281 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  39.74 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  43.75 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  43.3 
 
 		 405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  46.08 
 
 		 409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  41.98 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  43.3 
 
 		 405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  44.5 
 
 		 281 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  45.67 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  37.42 
 
 		 405 aa  163  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  44.5 
 
 		 281 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  44.5 
 
 		 281 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  44.5 
 
 		 281 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>