262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02993 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02993  SerB  100 
 
 		 327 aa  673    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  54.24 
 
 		 357 aa  262  6e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  54.15 
 
 		 369 aa  249  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  46.32 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  51.64 
 
 		 306 aa  245  8e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  45.61 
 
 		 325 aa  242  6e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  51.28 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  51.28 
 
 		 325 aa  238  9e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  54.3 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  55.88 
 
 		 317 aa  233  3e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  52.49 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  52.49 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  52.49 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  52.49 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  52.49 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  52.49 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  52.49 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  52.49 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  50.43 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  52.04 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  51.57 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  50 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  50 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  50 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  48.08 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  50 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  50 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  47.45 
 
 		 326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  53.43 
 
 		 322 aa  225  7e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  50.85 
 
 		 326 aa  225  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  50.85 
 
 		 326 aa  225  7e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1042  phosphoserine phosphatase  50.24 
 
 		 330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1107  phosphoserine phosphatase  49.76 
 
 		 330 aa  219  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829453 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  47.86 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1007  phosphoserine phosphatase SerB  47.04 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1046  phosphoserine phosphatase  49.76 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163618 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1223  phosphoserine phosphatase  50.71 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3222  phosphoserine phosphatase SerB  48.61 
 
 		 326 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1145  phosphoserine phosphatase SerB  47.75 
 
 		 326 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000532777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3361  phosphoserine phosphatase SerB  48.15 
 
 		 326 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2817  phosphoserine phosphatase SerB  46.58 
 
 		 331 aa  209  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1032  phosphoserine phosphatase SerB  46.79 
 
 		 348 aa  208  9e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3223  phosphoserine phosphatase SerB  47.69 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0978  phosphoserine phosphatase  46.47 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3373  phosphoserine phosphatase  48.53 
 
 		 330 aa  205  7e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.381097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3544  phosphoserine phosphatase SerB  49.28 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084049 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  50.43 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  50.43 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3043  phosphoserine phosphatase SerB  47.25 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  50.92 
 
 		 279 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  49.78 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  51.43 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  51.43 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  51.43 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  53.5 
 
 		 281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  43.67 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  49.07 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  43.61 
 
 		 404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2810  phosphoserine phosphatase SerB  51.34 
 
 		 327 aa  196  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  52.26 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  47.39 
 
 		 281 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  44.39 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  47.39 
 
 		 281 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  47.39 
 
 		 281 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  47.39 
 
 		 281 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  47.39 
 
 		 281 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  45.24 
 
 		 454 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  46.41 
 
 		 281 aa  192  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  45.24 
 
 		 568 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  45.29 
 
 		 407 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  45.65 
 
 		 429 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  43.17 
 
 		 404 aa  190  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  40.98 
 
 		 405 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  41.22 
 
 		 302 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  46.02 
 
 		 418 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  39.74 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  37.12 
 
 		 406 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  41.22 
 
 		 410 aa  186  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  45.13 
 
 		 418 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1969  phosphoserine phosphatase  46.12 
 
 		 240 aa  185  7e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  42.15 
 
 		 419 aa  185  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  43.17 
 
 		 410 aa  185  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  40.8 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  36.47 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  40 
 
 		 413 aa  183  3e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  43.72 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  41.41 
 
 		 408 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  40.08 
 
 		 410 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  38.16 
 
 		 404 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  41.63 
 
 		 411 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  42.62 
 
 		 435 aa  181  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  38.16 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  44.25 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  44.25 
 
 		 404 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  34.6 
 
 		 432 aa  179  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  38.16 
 
 		 404 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  42.31 
 
 		 400 aa  180  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  49.25 
 
 		 284 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  43.81 
 
 		 429 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  45.5 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>