282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1620 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
275 aa  559  1e-158  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  48.01 
 
 
278 aa  256  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  45.85 
 
 
302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  54.55 
 
 
316 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  54.55 
 
 
316 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  54.55 
 
 
281 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  54.55 
 
 
281 aa  234  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  47.1 
 
 
276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  51.5 
 
 
236 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  45.49 
 
 
281 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  56.8 
 
 
281 aa  232  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  52.23 
 
 
285 aa  231  7.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  53.18 
 
 
281 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  53.18 
 
 
316 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  47.35 
 
 
285 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  46.97 
 
 
310 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  48.28 
 
 
284 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  55.98 
 
 
279 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  56.8 
 
 
279 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  52.68 
 
 
236 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  56.31 
 
 
279 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  51.82 
 
 
307 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  54.46 
 
 
237 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  53.95 
 
 
235 aa  222  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  54.29 
 
 
454 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  55.07 
 
 
281 aa  221  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  55.07 
 
 
281 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  55.07 
 
 
281 aa  221  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  55.07 
 
 
281 aa  221  9e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  55.07 
 
 
281 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  54.29 
 
 
568 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  52.34 
 
 
241 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  46.55 
 
 
280 aa  218  7e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  54.11 
 
 
281 aa  218  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  50.24 
 
 
279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2506  phosphoserine phosphatase SerB  56.54 
 
 
238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3159  phosphoserine phosphatase  56.54 
 
 
238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  53.27 
 
 
237 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  44.79 
 
 
296 aa  210  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0913  phosphoserine phosphatase SerB  48.7 
 
 
296 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.697374  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  52.13 
 
 
264 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  49.53 
 
 
237 aa  203  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  50.24 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  43.67 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  41.95 
 
 
398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  44.03 
 
 
291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  48.13 
 
 
237 aa  195  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  50.49 
 
 
357 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  47.03 
 
 
298 aa  192  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  46.9 
 
 
326 aa  192  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  45.85 
 
 
410 aa  191  9e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  43.62 
 
 
291 aa  191  9e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  45.69 
 
 
327 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  46.58 
 
 
298 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  45.69 
 
 
372 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  44.98 
 
 
404 aa  189  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  41.92 
 
 
398 aa  189  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  43.21 
 
 
291 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  49.5 
 
 
296 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  46.12 
 
 
325 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  45.49 
 
 
412 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  42.57 
 
 
296 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  45.66 
 
 
298 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  42.91 
 
 
325 aa  186  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  46.85 
 
 
432 aa  186  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  45.81 
 
 
292 aa  186  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  48.54 
 
 
435 aa  186  5e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  45.49 
 
 
410 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  49.75 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  43.73 
 
 
411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  42.53 
 
 
420 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  44.25 
 
 
326 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  49.26 
 
 
296 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  43.38 
 
 
298 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  43.78 
 
 
438 aa  181  8.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  48.28 
 
 
291 aa  181  9.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  47.76 
 
 
322 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  46.12 
 
 
328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  45.26 
 
 
325 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  44.83 
 
 
325 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  44.29 
 
 
298 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  49.03 
 
 
419 aa  178  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  44.98 
 
 
404 aa  178  7e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  49.03 
 
 
306 aa  178  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  47.03 
 
 
292 aa  178  9e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  43.24 
 
 
403 aa  178  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  42.92 
 
 
419 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  42.36 
 
 
408 aa  177  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  46.8 
 
 
295 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  46.6 
 
 
406 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  46.6 
 
 
407 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  48.78 
 
 
325 aa  176  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  48.28 
 
 
226 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  43.64 
 
 
309 aa  175  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  43.36 
 
 
405 aa  174  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  44.74 
 
 
404 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  44.3 
 
 
404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  43.91 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  48.54 
 
 
322 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  38.43 
 
 
405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>