More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1368 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  100 
 
 		 284 aa  569  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  87.23 
 
 		 307 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  68.31 
 
 		 285 aa  387  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  67.96 
 
 		 310 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  69.96 
 
 		 279 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  67.61 
 
 		 285 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  65.38 
 
 		 279 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  68.9 
 
 		 279 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  65.72 
 
 		 454 aa  363  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  65.72 
 
 		 281 aa  363  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  65.72 
 
 		 281 aa  363  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  65.72 
 
 		 281 aa  363  1e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  65.72 
 
 		 281 aa  363  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  65.72 
 
 		 281 aa  363  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  65.72 
 
 		 568 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  66.08 
 
 		 281 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  64.08 
 
 		 281 aa  349  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  62.68 
 
 		 281 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  62.68 
 
 		 316 aa  345  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  62.5 
 
 		 281 aa  344  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  63.03 
 
 		 316 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  63.03 
 
 		 281 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  63.03 
 
 		 316 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  52.48 
 
 		 276 aa  280  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  54.26 
 
 		 279 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  57.08 
 
 		 281 aa  261  6e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  61.4 
 
 		 235 aa  258  6e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  59.53 
 
 		 236 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  59.26 
 
 		 236 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  58.45 
 
 		 241 aa  249  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  54.55 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  59.07 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0913  phosphoserine phosphatase SerB  53.11 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.697374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  55.84 
 
 		 296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  60.49 
 
 		 237 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  55.09 
 
 		 237 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  54.88 
 
 		 264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  56.48 
 
 		 237 aa  232  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  48.28 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3159  phosphoserine phosphatase  56.94 
 
 		 238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2506  phosphoserine phosphatase SerB  56.94 
 
 		 238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  45.99 
 
 		 278 aa  215  8e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  48.31 
 
 		 410 aa  205  7e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  49.79 
 
 		 432 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  48.31 
 
 		 414 aa  202  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  51.69 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  49.58 
 
 		 406 aa  200  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  43.21 
 
 		 406 aa  199  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  41.24 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  47.01 
 
 		 438 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  49.16 
 
 		 420 aa  199  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  50.72 
 
 		 418 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  48.73 
 
 		 298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  49.56 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  48.91 
 
 		 419 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  42.29 
 
 		 412 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  48.31 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  49.76 
 
 		 405 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  49.28 
 
 		 404 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  45.89 
 
 		 289 aa  194  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  47.49 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  48.79 
 
 		 410 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  49.76 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  51.27 
 
 		 429 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  51.21 
 
 		 411 aa  192  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  47.66 
 
 		 405 aa  192  6e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  49.76 
 
 		 404 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  49.76 
 
 		 415 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  47.98 
 
 		 408 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  46.41 
 
 		 410 aa  190  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  42.21 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  48.03 
 
 		 326 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  41.61 
 
 		 369 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  48.88 
 
 		 404 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  47.23 
 
 		 419 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  48.09 
 
 		 407 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  48.03 
 
 		 326 aa  189  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  48.03 
 
 		 326 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  47.46 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  46.81 
 
 		 405 aa  188  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  47.23 
 
 		 405 aa  187  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  48.79 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  43.83 
 
 		 398 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  48.65 
 
 		 403 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  48.8 
 
 		 404 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  47.85 
 
 		 429 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  41.91 
 
 		 409 aa  185  7e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  45.93 
 
 		 413 aa  185  7e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  44.58 
 
 		 398 aa  185  7e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  43.4 
 
 		 400 aa  185  9e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  46.43 
 
 		 435 aa  185  9e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  45.26 
 
 		 357 aa  185  9e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  45.21 
 
 		 328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  43.4 
 
 		 400 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  48.28 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  50.24 
 
 		 380 aa  183  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  47.37 
 
 		 404 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  41.33 
 
 		 404 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  43.42 
 
 		 400 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  46.15 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>