More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0557 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  97.13 
 
 		 418 aa  813    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 418 aa  837    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  88.83 
 
 		 404 aa  715    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  87.84 
 
 		 404 aa  714    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  86.7 
 
 		 429 aa  708    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  86.75 
 
 		 429 aa  721    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  75.97 
 
 		 415 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  77.17 
 
 		 404 aa  631  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  76.67 
 
 		 404 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  76.98 
 
 		 404 aa  628  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  75.93 
 
 		 404 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  64.84 
 
 		 410 aa  532  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  65.34 
 
 		 405 aa  528  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  59.61 
 
 		 406 aa  495  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  58.25 
 
 		 408 aa  495  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  58.46 
 
 		 410 aa  489  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  61.35 
 
 		 405 aa  488  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  57.61 
 
 		 404 aa  485  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  60.6 
 
 		 405 aa  481  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  58.96 
 
 		 412 aa  484  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  60.6 
 
 		 405 aa  481  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  57.21 
 
 		 404 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  58.6 
 
 		 411 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  56.03 
 
 		 413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  53.94 
 
 		 438 aa  450  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  55.39 
 
 		 410 aa  446  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  54.27 
 
 		 398 aa  427  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  43.53 
 
 		 398 aa  325  8.000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  47.74 
 
 		 411 aa  325  8.000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  44.33 
 
 		 407 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  44 
 
 		 406 aa  270  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  42.42 
 
 		 414 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  40.93 
 
 		 419 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  41.12 
 
 		 409 aa  266  5e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  42.75 
 
 		 403 aa  262  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  40.81 
 
 		 409 aa  261  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  41.73 
 
 		 432 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  41.85 
 
 		 420 aa  258  9e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  43 
 
 		 406 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  44.42 
 
 		 429 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  60.29 
 
 		 435 aa  249  9e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  40.69 
 
 		 421 aa  248  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  57.42 
 
 		 400 aa  242  7e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  57.42 
 
 		 400 aa  240  4e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  41.23 
 
 		 419 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1853  phosphoserine phosphatase SerB  40.49 
 
 		 417 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1834  phosphoserine phosphatase SerB  40.49 
 
 		 417 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0739277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1900  phosphoserine phosphatase SerB  40.49 
 
 		 417 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  41.58 
 
 		 380 aa  233  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  40.2 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  39.5 
 
 		 410 aa  229  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2083  phosphoserine phosphatase SerB  41.6 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  35.84 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1310  phosphoserine phosphatase SerB  43.99 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  41.33 
 
 		 306 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  41.33 
 
 		 306 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  52.45 
 
 		 326 aa  210  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  47.79 
 
 		 326 aa  209  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  50.86 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  46.38 
 
 		 325 aa  206  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  45.24 
 
 		 302 aa  206  7e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  49.56 
 
 		 322 aa  206  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  52.29 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  48.39 
 
 		 281 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  52.29 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  46.38 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  48.39 
 
 		 316 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  48.39 
 
 		 316 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  47.58 
 
 		 281 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  47.79 
 
 		 325 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  49.12 
 
 		 322 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  49.12 
 
 		 322 aa  203  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  49.12 
 
 		 322 aa  203  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  49.12 
 
 		 322 aa  203  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  49.12 
 
 		 322 aa  203  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  49.12 
 
 		 322 aa  203  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  49.12 
 
 		 322 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  49.12 
 
 		 322 aa  203  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  51.83 
 
 		 326 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  47.1 
 
 		 298 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  48.67 
 
 		 322 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  51.69 
 
 		 284 aa  201  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  47.58 
 
 		 281 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  46.72 
 
 		 298 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  45.8 
 
 		 285 aa  200  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  48.89 
 
 		 325 aa  199  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  50.24 
 
 		 306 aa  199  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  47.79 
 
 		 322 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  47.79 
 
 		 322 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  47.79 
 
 		 322 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  46.15 
 
 		 279 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  47.79 
 
 		 322 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  46.22 
 
 		 285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  47.79 
 
 		 322 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  45.95 
 
 		 298 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  45.92 
 
 		 322 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  45.8 
 
 		 310 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  46.37 
 
 		 279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  47.58 
 
 		 316 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  47.58 
 
 		 281 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>