More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1075 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  100 
 
 		 405 aa  818    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  65.34 
 
 		 418 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  64.59 
 
 		 404 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  64.59 
 
 		 418 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  63.84 
 
 		 429 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  62.87 
 
 		 410 aa  519  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  63.09 
 
 		 404 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  61.88 
 
 		 429 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  61.6 
 
 		 404 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  61.6 
 
 		 404 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  61.35 
 
 		 415 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  60.1 
 
 		 404 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  60.35 
 
 		 404 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  60.3 
 
 		 406 aa  491  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  63.34 
 
 		 405 aa  488  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  57.86 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  63.59 
 
 		 405 aa  489  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  57.39 
 
 		 408 aa  486  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  63.34 
 
 		 405 aa  487  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  59.06 
 
 		 413 aa  482  1e-135  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  58.96 
 
 		 410 aa  481  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  59.95 
 
 		 412 aa  480  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  58.85 
 
 		 411 aa  479  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  59.06 
 
 		 438 aa  474  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  57.46 
 
 		 404 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  54.73 
 
 		 410 aa  461  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  53.23 
 
 		 398 aa  418  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  47.75 
 
 		 411 aa  345  6e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  42.82 
 
 		 398 aa  318  9e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  42.75 
 
 		 406 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  41.79 
 
 		 409 aa  280  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  40.05 
 
 		 419 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  42.51 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  41.56 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  41.15 
 
 		 414 aa  268  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  41.4 
 
 		 421 aa  266  5.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  39.31 
 
 		 432 aa  262  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  39.41 
 
 		 409 aa  260  4e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  41.27 
 
 		 420 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  40.9 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  54.76 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  41.52 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  40.82 
 
 		 419 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  54.76 
 
 		 400 aa  242  7e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  41.73 
 
 		 380 aa  241  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  36.13 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  40.29 
 
 		 410 aa  237  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2083  phosphoserine phosphatase SerB  40.49 
 
 		 419 aa  236  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  39.51 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  53.33 
 
 		 435 aa  233  6e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1853  phosphoserine phosphatase SerB  40.05 
 
 		 417 aa  229  8e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1834  phosphoserine phosphatase SerB  40.05 
 
 		 417 aa  229  8e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0739277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1900  phosphoserine phosphatase SerB  40.05 
 
 		 417 aa  229  8e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  43.19 
 
 		 306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  43.19 
 
 		 306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  51.21 
 
 		 326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1310  phosphoserine phosphatase SerB  41.03 
 
 		 303 aa  213  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193327  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  46.84 
 
 		 285 aa  210  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  46.84 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  46.84 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  47.3 
 
 		 297 aa  205  9e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  49.51 
 
 		 326 aa  204  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  46.02 
 
 		 325 aa  203  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  43.49 
 
 		 279 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  43.35 
 
 		 306 aa  202  9e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  50.23 
 
 		 279 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  46.02 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  46.37 
 
 		 279 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  51.44 
 
 		 326 aa  199  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  51.44 
 
 		 326 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  48.87 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  48.87 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  47.01 
 
 		 281 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  48.87 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  48.87 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  48.87 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  48.87 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  52.88 
 
 		 281 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  48.87 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  51.44 
 
 		 326 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  48.87 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  43.87 
 
 		 279 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2123  phosphoserine phosphatase  46.4 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0782028  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  51.53 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  43.59 
 
 		 307 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  49.76 
 
 		 284 aa  196  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  44.36 
 
 		 281 aa  196  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  44.17 
 
 		 317 aa  196  9e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  47.96 
 
 		 322 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  48.54 
 
 		 568 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  50.52 
 
 		 322 aa  194  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  42.38 
 
 		 454 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  48.29 
 
 		 357 aa  193  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  45.13 
 
 		 325 aa  192  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  42.38 
 
 		 281 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  42.38 
 
 		 281 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  42.38 
 
 		 281 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  42.38 
 
 		 281 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  42.38 
 
 		 281 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  48.6 
 
 		 322 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>