More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2184 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
435 aa  892    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  49.26 
 
 
400 aa  379  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  49.51 
 
 
400 aa  377  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  60 
 
 
418 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  60.29 
 
 
418 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  58.41 
 
 
404 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  58.41 
 
 
404 aa  246  8e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  57.62 
 
 
429 aa  244  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  57.94 
 
 
404 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  57.94 
 
 
404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  58.1 
 
 
429 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  58.1 
 
 
404 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  57.48 
 
 
415 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  57.48 
 
 
404 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  51.75 
 
 
404 aa  239  5.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  53.74 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  53.33 
 
 
405 aa  233  6e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  50.44 
 
 
410 aa  232  9e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  51.32 
 
 
411 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  52.38 
 
 
410 aa  226  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
410 aa  226  8e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  53.11 
 
 
404 aa  224  3e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
405 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  47.58 
 
 
398 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  50.23 
 
 
398 aa  220  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  49.58 
 
 
405 aa  219  8.999999999999998e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  50 
 
 
413 aa  219  1e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  51.64 
 
 
411 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  47.92 
 
 
412 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  42.61 
 
 
438 aa  217  4e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  49.17 
 
 
405 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  49.54 
 
 
406 aa  216  7e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  50.7 
 
 
406 aa  211  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  48.37 
 
 
432 aa  209  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1310  phosphoserine phosphatase SerB  44.31 
 
 
303 aa  202  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193327  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  47.44 
 
 
403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  49.07 
 
 
429 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  48.33 
 
 
407 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  48.8 
 
 
420 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  48.57 
 
 
406 aa  193  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  46.9 
 
 
281 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  44.1 
 
 
409 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  46.46 
 
 
316 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  43.73 
 
 
291 aa  190  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  47.35 
 
 
316 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  47.35 
 
 
316 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  44.65 
 
 
419 aa  190  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  47.35 
 
 
281 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  45.89 
 
 
307 aa  188  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  46.9 
 
 
281 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  46.02 
 
 
281 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  42.42 
 
 
325 aa  186  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  48.54 
 
 
275 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  46.43 
 
 
284 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  47 
 
 
298 aa  184  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  43.37 
 
 
281 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  45.02 
 
 
419 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  47 
 
 
298 aa  182  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  41.99 
 
 
325 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  44.69 
 
 
568 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  44.69 
 
 
454 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  42.62 
 
 
327 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  46.89 
 
 
409 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  45.85 
 
 
326 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  44.69 
 
 
281 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  44.69 
 
 
281 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  42.92 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  44.69 
 
 
281 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  44.69 
 
 
281 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  44.69 
 
 
281 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  42.92 
 
 
322 aa  180  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  42.92 
 
 
322 aa  180  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  41.77 
 
 
306 aa  180  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  42.92 
 
 
322 aa  180  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  46.12 
 
 
410 aa  180  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  42.92 
 
 
322 aa  180  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  42.92 
 
 
322 aa  180  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  42.92 
 
 
322 aa  180  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  42.92 
 
 
322 aa  180  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  42.92 
 
 
322 aa  180  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  47.87 
 
 
296 aa  180  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  46.89 
 
 
414 aa  180  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  45.26 
 
 
298 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  41.99 
 
 
326 aa  180  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  45.89 
 
 
326 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  41.99 
 
 
326 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  46.76 
 
 
295 aa  179  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  41.99 
 
 
326 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  44.69 
 
 
281 aa  179  9e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  45.22 
 
 
296 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  38.15 
 
 
299 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  42.48 
 
 
322 aa  179  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  43.78 
 
 
291 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  46.15 
 
 
292 aa  177  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  45.05 
 
 
279 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  44.65 
 
 
380 aa  176  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  45.5 
 
 
296 aa  176  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  42.99 
 
 
298 aa  175  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  41.59 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  45.1 
 
 
322 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>