More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3316 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  100 
 
 		 292 aa  567  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  77.16 
 
 		 291 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  75.6 
 
 		 291 aa  428  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  75.79 
 
 		 291 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  75.44 
 
 		 291 aa  417  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  65.52 
 
 		 291 aa  349  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  61.86 
 
 		 291 aa  337  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  58.11 
 
 		 296 aa  315  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  57.68 
 
 		 296 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  57.43 
 
 		 296 aa  311  5.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  57.97 
 
 		 295 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  56.95 
 
 		 299 aa  299  5e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  56.85 
 
 		 299 aa  293  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  58.5 
 
 		 297 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  56.85 
 
 		 299 aa  291  6e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  55.1 
 
 		 295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  53.58 
 
 		 296 aa  278  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  52.94 
 
 		 296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  53.56 
 
 		 297 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  53.56 
 
 		 297 aa  269  4e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  53.74 
 
 		 298 aa  267  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  53.06 
 
 		 298 aa  265  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  53.74 
 
 		 298 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  52.88 
 
 		 298 aa  264  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  51.19 
 
 		 309 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  59.21 
 
 		 289 aa  255  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  61.43 
 
 		 226 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  54.05 
 
 		 299 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  54.76 
 
 		 297 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  53.29 
 
 		 332 aa  252  6e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  59.73 
 
 		 241 aa  250  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  50.17 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  52.38 
 
 		 298 aa  242  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  51.36 
 
 		 325 aa  241  7.999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  49.66 
 
 		 292 aa  237  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  49.49 
 
 		 297 aa  232  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  47.62 
 
 		 298 aa  232  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  47.44 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  44.33 
 
 		 432 aa  201  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  50.22 
 
 		 403 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  41.24 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  42.47 
 
 		 419 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  50.22 
 
 		 429 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  49.14 
 
 		 420 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  46.41 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  47.03 
 
 		 275 aa  178  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  42.08 
 
 		 410 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  46.15 
 
 		 435 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  45.89 
 
 		 407 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  44.98 
 
 		 398 aa  175  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  49.3 
 
 		 380 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  47.8 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  49.77 
 
 		 419 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  49.02 
 
 		 279 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  52.75 
 
 		 316 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  52.75 
 
 		 316 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  47.8 
 
 		 285 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  52.75 
 
 		 281 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  53.3 
 
 		 281 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  53.3 
 
 		 316 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  43.37 
 
 		 418 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  52.2 
 
 		 281 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  50.53 
 
 		 281 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  47.8 
 
 		 310 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  46.09 
 
 		 372 aa  169  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  45.1 
 
 		 326 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  46.26 
 
 		 429 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  46.04 
 
 		 326 aa  169  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  45.95 
 
 		 418 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  46.26 
 
 		 404 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  44.9 
 
 		 327 aa  169  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  44.14 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  44.14 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  44.08 
 
 		 400 aa  167  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  45.41 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  50.25 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  49.25 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  43.6 
 
 		 400 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  45.81 
 
 		 414 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  46.19 
 
 		 404 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  43.75 
 
 		 398 aa  166  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  48.83 
 
 		 404 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  42.21 
 
 		 404 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  48.72 
 
 		 281 aa  165  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  42.35 
 
 		 404 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  46.51 
 
 		 409 aa  165  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0978  phosphoserine phosphatase  44.64 
 
 		 316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  44.27 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  43.2 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  43.2 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  45.12 
 
 		 406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  45.11 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  44.65 
 
 		 438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  44.64 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  43.48 
 
 		 409 aa  163  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  45.58 
 
 		 404 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  45.02 
 
 		 412 aa  163  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  45.97 
 
 		 421 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2436  phosphoserine phosphatase SerB  34.27 
 
 		 295 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  49.45 
 
 		 281 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>