More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3019 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  100 
 
 		 291 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  77.16 
 
 		 292 aa  429  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  73.1 
 
 		 291 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  71.72 
 
 		 291 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  71.72 
 
 		 291 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  65.74 
 
 		 291 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  64.01 
 
 		 291 aa  356  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  60.34 
 
 		 296 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  59.66 
 
 		 296 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  58.76 
 
 		 296 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  58.97 
 
 		 299 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  58.62 
 
 		 295 aa  316  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  58.02 
 
 		 295 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  57.93 
 
 		 299 aa  308  5.9999999999999995e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  57.93 
 
 		 299 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  54.23 
 
 		 296 aa  289  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  54.39 
 
 		 297 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  56.36 
 
 		 297 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  53.26 
 
 		 296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  54.3 
 
 		 297 aa  280  3e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  51.88 
 
 		 298 aa  276  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  55.44 
 
 		 297 aa  272  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  52.9 
 
 		 298 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  52.56 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  52.53 
 
 		 299 aa  265  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  48.81 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  61.43 
 
 		 226 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  53.24 
 
 		 298 aa  261  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  59.73 
 
 		 289 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  50.85 
 
 		 298 aa  259  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  60.53 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  48.64 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  49.13 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  48.31 
 
 		 292 aa  242  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  47.81 
 
 		 297 aa  227  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  48.12 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  44.07 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  48.45 
 
 		 294 aa  211  7.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  48.02 
 
 		 398 aa  196  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  43.73 
 
 		 435 aa  190  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  45.13 
 
 		 398 aa  182  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  48.28 
 
 		 275 aa  181  9.000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  42.63 
 
 		 410 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  44.55 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  47.77 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  45.41 
 
 		 406 aa  176  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  42.8 
 
 		 404 aa  175  8e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  44.35 
 
 		 432 aa  175  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  45 
 
 		 302 aa  175  9e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  41.13 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  47.44 
 
 		 419 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  44.08 
 
 		 400 aa  172  6.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  46.88 
 
 		 404 aa  172  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  45.78 
 
 		 420 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  41.77 
 
 		 404 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  43.66 
 
 		 325 aa  169  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  43.11 
 
 		 410 aa  169  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  43.67 
 
 		 403 aa  168  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  44.5 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  41.6 
 
 		 408 aa  168  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  44.5 
 
 		 326 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3223  phosphoserine phosphatase SerB  44.61 
 
 		 326 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  44.5 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3361  phosphoserine phosphatase SerB  44.61 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  41.37 
 
 		 429 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  44.13 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2817  phosphoserine phosphatase SerB  44.61 
 
 		 331 aa  166  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1145  phosphoserine phosphatase SerB  44.12 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000532777 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  43.56 
 
 		 411 aa  166  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  45.41 
 
 		 429 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  38.83 
 
 		 419 aa  166  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  43.12 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  45.02 
 
 		 404 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3222  phosphoserine phosphatase SerB  44.12 
 
 		 326 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  40.16 
 
 		 429 aa  165  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  46.6 
 
 		 276 aa  165  9e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  44.61 
 
 		 326 aa  165  9e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  46.53 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  37.3 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  42.86 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1094  phosphoserine phosphatase  44.88 
 
 		 230 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  39.49 
 
 		 438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  43.69 
 
 		 284 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  42.11 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  44.12 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  43.86 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  47.24 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2259  phosphoserine phosphatase  48 
 
 		 294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.148184  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  40.23 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  47.24 
 
 		 316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  41.94 
 
 		 325 aa  162  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2436  phosphoserine phosphatase SerB  39.17 
 
 		 295 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  46.73 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  46.73 
 
 		 281 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  46.73 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  45.81 
 
 		 281 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  40.96 
 
 		 418 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  43.06 
 
 		 322 aa  162  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  40.23 
 
 		 285 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0191931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>