More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0008 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 291 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  93.1 
 
 		 291 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  92.07 
 
 		 291 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  75.6 
 
 		 292 aa  428  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  73.1 
 
 		 291 aa  423  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  64.36 
 
 		 291 aa  353  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  59.79 
 
 		 291 aa  322  4e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  56.76 
 
 		 296 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  56.76 
 
 		 296 aa  308  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  55.97 
 
 		 296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  54.08 
 
 		 295 aa  299  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  54.58 
 
 		 299 aa  295  9e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  56.51 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  56.27 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  55.67 
 
 		 295 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  54.58 
 
 		 299 aa  289  5.0000000000000004e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  54.58 
 
 		 299 aa  288  7e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  55.56 
 
 		 297 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  53.92 
 
 		 296 aa  278  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  52.72 
 
 		 298 aa  277  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  55.97 
 
 		 297 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  52.94 
 
 		 296 aa  273  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  51.84 
 
 		 309 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  55.07 
 
 		 299 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  64.41 
 
 		 226 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  53.06 
 
 		 298 aa  266  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  53.06 
 
 		 298 aa  266  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  52.72 
 
 		 298 aa  265  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  62.72 
 
 		 241 aa  260  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  54.08 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  51.56 
 
 		 332 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  58.41 
 
 		 289 aa  251  9.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  49.66 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  50.85 
 
 		 297 aa  248  9e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  50.85 
 
 		 325 aa  246  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  48.47 
 
 		 292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  48.04 
 
 		 298 aa  235  6e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  41.84 
 
 		 432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  47.86 
 
 		 294 aa  196  6e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  43.21 
 
 		 275 aa  189  7e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  39.56 
 
 		 302 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  47.73 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  49.3 
 
 		 419 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  46.05 
 
 		 419 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  46.01 
 
 		 398 aa  179  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  45.41 
 
 		 403 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  43.53 
 
 		 410 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  44.66 
 
 		 429 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  40.5 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  46.61 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  43.98 
 
 		 435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  49.53 
 
 		 297 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  40.21 
 
 		 310 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  40.91 
 
 		 285 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  45.22 
 
 		 406 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  41.25 
 
 		 404 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  46.92 
 
 		 281 aa  170  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  42.47 
 
 		 420 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  42.8 
 
 		 404 aa  169  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  44.3 
 
 		 398 aa  169  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1478  phosphoserine phosphatase  46.08 
 
 		 215 aa  169  7e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  41.5 
 
 		 418 aa  168  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  40.6 
 
 		 404 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  44.55 
 
 		 400 aa  168  9e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  41.18 
 
 		 429 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  41.18 
 
 		 404 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  44.64 
 
 		 372 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  40.98 
 
 		 404 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  44.08 
 
 		 400 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  44.64 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  44.65 
 
 		 404 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  40.98 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  41.5 
 
 		 418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  44.81 
 
 		 411 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  43.05 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  44.24 
 
 		 438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  47.37 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2259  phosphoserine phosphatase  49.53 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.148184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  41.8 
 
 		 407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  45 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  46.15 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  38.96 
 
 		 369 aa  163  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  44.23 
 
 		 325 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  43.6 
 
 		 404 aa  162  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  47.12 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  47.12 
 
 		 236 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  42.11 
 
 		 421 aa  162  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  43.75 
 
 		 326 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  40.26 
 
 		 278 aa  162  9e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  43.13 
 
 		 276 aa  162  9e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  43.75 
 
 		 326 aa  162  9e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  43.75 
 
 		 326 aa  162  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  45.25 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2817  phosphoserine phosphatase SerB  41.77 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  44.23 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  39.53 
 
 		 429 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  42.73 
 
 		 404 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3223  phosphoserine phosphatase SerB  41.39 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3361  phosphoserine phosphatase SerB  40.98 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  44.16 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>