More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6188 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 298 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  84.23 
 
 		 298 aa  485  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  74.66 
 
 		 298 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  75.76 
 
 		 298 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  75.42 
 
 		 298 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  79.32 
 
 		 297 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  64.65 
 
 		 297 aa  359  3e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  63.42 
 
 		 296 aa  353  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  64.65 
 
 		 297 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  63.42 
 
 		 297 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  63.42 
 
 		 297 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  62.63 
 
 		 299 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  59.4 
 
 		 299 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  59.4 
 
 		 299 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  71.69 
 
 		 226 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  57.43 
 
 		 295 aa  310  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  58.39 
 
 		 299 aa  305  8.000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  56.23 
 
 		 295 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  57.58 
 
 		 325 aa  300  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  56.04 
 
 		 309 aa  288  8e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  66.81 
 
 		 241 aa  285  5.999999999999999e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  52.19 
 
 		 296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  59.92 
 
 		 289 aa  283  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  54.36 
 
 		 296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  52.13 
 
 		 296 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  51.52 
 
 		 296 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  53.24 
 
 		 291 aa  276  3e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  54.76 
 
 		 291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  54.76 
 
 		 291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  54.08 
 
 		 291 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  55.3 
 
 		 291 aa  267  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  53.74 
 
 		 291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  52.04 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  48.72 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  51.34 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  56.58 
 
 		 292 aa  229  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  50.33 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  46.46 
 
 		 298 aa  218  7e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  43.32 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  44.3 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2259  phosphoserine phosphatase  52.68 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.148184  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  47.03 
 
 		 284 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  44.29 
 
 		 275 aa  185  6e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  43.51 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  45.56 
 
 		 411 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  41.43 
 
 		 278 aa  181  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  50.74 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  41.78 
 
 		 419 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  46.29 
 
 		 432 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  41.96 
 
 		 410 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  46.85 
 
 		 281 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  49.52 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  43.78 
 
 		 435 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  43.59 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  43.59 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  45.38 
 
 		 404 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  43.14 
 
 		 404 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  45.61 
 
 		 279 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  43.86 
 
 		 398 aa  176  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  43.59 
 
 		 326 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  44.87 
 
 		 285 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  44.49 
 
 		 404 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  42.75 
 
 		 429 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  43.97 
 
 		 404 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  44.02 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  42.91 
 
 		 418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  46.22 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  46 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  47.35 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  46.35 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  49.25 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  43.97 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  45.69 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  42.75 
 
 		 418 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  41.83 
 
 		 410 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  50.79 
 
 		 237 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  48.08 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  45.85 
 
 		 406 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  43.12 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  48.76 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  41.22 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  41.22 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  47.55 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  41.96 
 
 		 404 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  45.29 
 
 		 438 aa  170  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  41.18 
 
 		 429 aa  168  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  42.6 
 
 		 372 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  42.35 
 
 		 404 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  42.74 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  46.63 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  42.6 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  44.35 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  44.92 
 
 		 281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  46.31 
 
 		 410 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  40 
 
 		 408 aa  166  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  43.93 
 
 		 316 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  43.93 
 
 		 316 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  44.03 
 
 		 281 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  44.03 
 
 		 281 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  44.03 
 
 		 281 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>