288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3347 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 297 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  88.55 
 
 		 297 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  81.69 
 
 		 297 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  75.93 
 
 		 297 aa  434  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  71.86 
 
 		 296 aa  431  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  91.15 
 
 		 226 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  78.57 
 
 		 241 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  62.96 
 
 		 298 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  66.22 
 
 		 299 aa  345  4e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  63.18 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  60.34 
 
 		 299 aa  330  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  64.65 
 
 		 298 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  60 
 
 		 299 aa  328  7e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  59.73 
 
 		 299 aa  325  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  60.81 
 
 		 298 aa  324  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  60.61 
 
 		 298 aa  323  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  58.64 
 
 		 295 aa  323  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  60.27 
 
 		 298 aa  323  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  56.76 
 
 		 296 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  57.29 
 
 		 295 aa  314  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  55.59 
 
 		 296 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  56.9 
 
 		 309 aa  311  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  56.27 
 
 		 296 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  58.31 
 
 		 296 aa  306  3e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  60.47 
 
 		 297 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  56.27 
 
 		 291 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  54.39 
 
 		 291 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  54.61 
 
 		 291 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  61.28 
 
 		 289 aa  282  6.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  53.92 
 
 		 291 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  53.56 
 
 		 292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  56.54 
 
 		 291 aa  266  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  59.91 
 
 		 291 aa  264  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  51.36 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  48.22 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  48.3 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  51.5 
 
 		 294 aa  229  6e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  45.42 
 
 		 298 aa  219  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  46.7 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  49.75 
 
 		 302 aa  178  8e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  47.81 
 
 		 429 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  42.22 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  45.92 
 
 		 307 aa  175  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  48.53 
 
 		 284 aa  175  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2259  phosphoserine phosphatase  53.24 
 
 		 294 aa  175  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.148184  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  45.22 
 
 		 435 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  46.22 
 
 		 420 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  43.91 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  45.45 
 
 		 264 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  44.93 
 
 		 432 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  41.99 
 
 		 410 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  45.13 
 
 		 404 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  44.59 
 
 		 404 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  43.48 
 
 		 418 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  45.18 
 
 		 419 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  44.93 
 
 		 404 aa  169  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  46.97 
 
 		 276 aa  169  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  43.91 
 
 		 429 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  47.57 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  43.48 
 
 		 418 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  48.74 
 
 		 279 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  45.13 
 
 		 404 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  42.61 
 
 		 429 aa  168  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  43.91 
 
 		 404 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  44.64 
 
 		 325 aa  168  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  44.49 
 
 		 415 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  44.49 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  47.57 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  46.12 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  46.51 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  46.12 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  46.12 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  47.75 
 
 		 241 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  48.24 
 
 		 279 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  43.5 
 
 		 411 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  46.12 
 
 		 325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  44.3 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  46.73 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  46.73 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  46.31 
 
 		 454 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  44.49 
 
 		 406 aa  163  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  46.73 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  46.73 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  46.73 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  43.36 
 
 		 408 aa  163  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  47.29 
 
 		 281 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  45.37 
 
 		 235 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  47.29 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  47.29 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  47.29 
 
 		 281 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  47.74 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  46.31 
 
 		 568 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  42.65 
 
 		 400 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  46.19 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  46.6 
 
 		 325 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  49.01 
 
 		 237 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  46.31 
 
 		 281 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  44.95 
 
 		 322 aa  162  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  42.29 
 
 		 404 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>