268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2345 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
297 aa  598  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  75.93 
 
 
297 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  74.32 
 
 
296 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  91.25 
 
 
241 aa  417  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  74.58 
 
 
297 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  71.96 
 
 
297 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  76.34 
 
 
226 aa  348  9e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  62.42 
 
 
298 aa  346  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  60.81 
 
 
299 aa  335  5e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  60.33 
 
 
299 aa  334  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  63 
 
 
299 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  57.91 
 
 
296 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  57.77 
 
 
296 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  59.12 
 
 
299 aa  325  7e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  63.42 
 
 
298 aa  322  7e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  59.6 
 
 
298 aa  319  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  59.6 
 
 
298 aa  318  5e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  57.97 
 
 
295 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  59.12 
 
 
298 aa  316  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  56.12 
 
 
295 aa  316  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  56.42 
 
 
296 aa  315  6e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  59.12 
 
 
325 aa  311  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  56.08 
 
 
296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  56.51 
 
 
291 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  56.16 
 
 
291 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  54.21 
 
 
309 aa  295  8e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  55.48 
 
 
291 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  59.6 
 
 
297 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  54.3 
 
 
291 aa  293  3e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  53.56 
 
 
292 aa  281  9e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  53.58 
 
 
291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  58.65 
 
 
289 aa  272  6e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  54.42 
 
 
292 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  50.51 
 
 
291 aa  261  6.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  51 
 
 
299 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  49.32 
 
 
332 aa  239  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  45.27 
 
 
298 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  49.66 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2259  phosphoserine phosphatase  53.27 
 
 
294 aa  192  8e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.148184  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  47.58 
 
 
297 aa  189  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  42.42 
 
 
278 aa  178  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  45.76 
 
 
264 aa  176  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  45.32 
 
 
302 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  45.34 
 
 
284 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  45.66 
 
 
281 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  44.26 
 
 
307 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  47.24 
 
 
279 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  41.48 
 
 
275 aa  168  9e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  45.37 
 
 
415 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  46.73 
 
 
279 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  46.02 
 
 
404 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  45.37 
 
 
404 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  45.98 
 
 
404 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  44.78 
 
 
418 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  43.61 
 
 
432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  47.17 
 
 
404 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  44.35 
 
 
418 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  46.8 
 
 
281 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  43.48 
 
 
429 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  43.56 
 
 
420 aa  165  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  45.02 
 
 
400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  47.03 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  42.06 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  45.03 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  46.63 
 
 
237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  43.39 
 
 
429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  44.54 
 
 
419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  47.83 
 
 
241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  46.31 
 
 
281 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  43.67 
 
 
372 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  44.49 
 
 
404 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  43.42 
 
 
403 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  44.55 
 
 
400 aa  163  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  46.31 
 
 
316 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  43.91 
 
 
429 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  46.31 
 
 
316 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  43.91 
 
 
404 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  46.23 
 
 
279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  43.35 
 
 
327 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  40.24 
 
 
435 aa  162  7e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  45.32 
 
 
281 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  45.32 
 
 
316 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  45.81 
 
 
281 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40365  phosphoserine phosphatase activity  41.85 
 
 
306 aa  161  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.288179  normal  0.883376 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  44.07 
 
 
404 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  41.56 
 
 
410 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  46.92 
 
 
236 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  44.33 
 
 
454 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  45.02 
 
 
438 aa  160  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  45.73 
 
 
296 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  41.59 
 
 
411 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  44.72 
 
 
281 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  44.72 
 
 
281 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  44.72 
 
 
281 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  44.66 
 
 
326 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  44.72 
 
 
281 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  44.72 
 
 
281 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  44.33 
 
 
568 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  44.66 
 
 
326 aa  160  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  44.66 
 
 
326 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>