288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6089 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  100 
 
 		 296 aa  592  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  71.86 
 
 		 297 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  74.32 
 
 		 297 aa  424  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  70.51 
 
 		 297 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  71.53 
 
 		 297 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  79.75 
 
 		 241 aa  363  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  76.79 
 
 		 226 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  61.54 
 
 		 298 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  60.81 
 
 		 299 aa  338  8e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  60.47 
 
 		 299 aa  335  3.9999999999999995e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  63.42 
 
 		 298 aa  331  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  57.29 
 
 		 296 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  56.95 
 
 		 296 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  60.14 
 
 		 298 aa  326  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  59.26 
 
 		 298 aa  322  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  61.49 
 
 		 299 aa  322  7e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  57.63 
 
 		 295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  58.59 
 
 		 298 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  57.29 
 
 		 296 aa  318  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  57.09 
 
 		 299 aa  317  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  56.08 
 
 		 296 aa  315  4e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  59.46 
 
 		 325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  62.03 
 
 		 297 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  55.25 
 
 		 295 aa  306  3e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  54.88 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  53.26 
 
 		 291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  62.17 
 
 		 289 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  53.58 
 
 		 292 aa  278  6e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  53.92 
 
 		 291 aa  278  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  53.58 
 
 		 291 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  51.88 
 
 		 291 aa  271  9e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  49.32 
 
 		 291 aa  259  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  53.44 
 
 		 291 aa  258  8e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  49.49 
 
 		 292 aa  249  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  49.33 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  52.65 
 
 		 294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  49.44 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  47.33 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2259  phosphoserine phosphatase  49.56 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.148184  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  44.29 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  43.86 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  45.22 
 
 		 435 aa  179  5.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  49.02 
 
 		 284 aa  178  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  46.19 
 
 		 411 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  45.97 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  41.39 
 
 		 410 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  41.41 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  48.24 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  47.55 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  46.22 
 
 		 420 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  49.25 
 
 		 279 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  46.22 
 
 		 418 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  40.23 
 
 		 357 aa  171  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  44.81 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  40.23 
 
 		 398 aa  170  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  42.23 
 
 		 404 aa  170  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  44.69 
 
 		 418 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  41.67 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  44.49 
 
 		 404 aa  169  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  45.98 
 
 		 404 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  45.13 
 
 		 404 aa  169  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  44.74 
 
 		 404 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  49.75 
 
 		 223 aa  168  8e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  44.74 
 
 		 429 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  45.33 
 
 		 415 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  42.39 
 
 		 432 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  45.55 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  44.34 
 
 		 400 aa  168  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  45.33 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  42.46 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  46.23 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  46.8 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  49.28 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  46.23 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  46.23 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  46.23 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  46.23 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  46.63 
 
 		 264 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  44.23 
 
 		 325 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  46.05 
 
 		 429 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  45.81 
 
 		 454 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  42.54 
 
 		 325 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  46.73 
 
 		 279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  44.21 
 
 		 413 aa  165  9e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  45.81 
 
 		 568 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  42 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  45.32 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  46.31 
 
 		 281 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  46.31 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  46.31 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  44.23 
 
 		 325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  47.6 
 
 		 235 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  43.94 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  39.93 
 
 		 409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  45.19 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  45.32 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  46.23 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  46.53 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  45.73 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  45.18 
 
 		 410 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>