More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2574 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  100 
 
 
420 aa  811    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  64.32 
 
 
406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  68.38 
 
 
403 aa  456  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  63.91 
 
 
407 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  57.64 
 
 
419 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  60.1 
 
 
429 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  58.85 
 
 
432 aa  430  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  54.34 
 
 
409 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  56.08 
 
 
414 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  55.19 
 
 
406 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  55 
 
 
421 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  54.86 
 
 
380 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  51.79 
 
 
409 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  56.12 
 
 
410 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  54.16 
 
 
410 aa  355  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  53.28 
 
 
419 aa  348  9e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2083  phosphoserine phosphatase SerB  54.99 
 
 
419 aa  343  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726973  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1834  phosphoserine phosphatase SerB  53.35 
 
 
417 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0739277  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1853  phosphoserine phosphatase SerB  53.35 
 
 
417 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1900  phosphoserine phosphatase SerB  53.35 
 
 
417 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  53.97 
 
 
306 aa  298  9e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  53.97 
 
 
306 aa  298  9e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  43.07 
 
 
398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  41.94 
 
 
411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  42.07 
 
 
408 aa  273  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  41.79 
 
 
398 aa  272  7e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  42.25 
 
 
404 aa  268  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  41.6 
 
 
418 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  42.68 
 
 
404 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  42.68 
 
 
429 aa  265  8e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  40.15 
 
 
410 aa  265  8.999999999999999e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  41.44 
 
 
405 aa  265  8.999999999999999e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  41.69 
 
 
418 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  42.43 
 
 
404 aa  264  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  40.6 
 
 
404 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  41.44 
 
 
429 aa  263  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  41.35 
 
 
404 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  41.35 
 
 
415 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  41.1 
 
 
404 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  39.85 
 
 
404 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  40.7 
 
 
406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  38.15 
 
 
410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  43.15 
 
 
404 aa  252  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  53.7 
 
 
297 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  37.84 
 
 
410 aa  249  7e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  39.11 
 
 
412 aa  249  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  40.1 
 
 
405 aa  246  6e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  39.65 
 
 
405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  39.85 
 
 
405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2123  phosphoserine phosphatase  53.91 
 
 
297 aa  240  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0782028  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  36.93 
 
 
413 aa  237  3e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  37.78 
 
 
438 aa  236  4e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  35.83 
 
 
400 aa  234  3e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  38.35 
 
 
411 aa  226  7e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  57.6 
 
 
223 aa  223  7e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21750  phosphoserine phosphatase SerB  59.02 
 
 
234 aa  206  5e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.875318  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1168  phosphoserine phosphatase SerB  54.23 
 
 
213 aa  205  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.748705 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  49.16 
 
 
284 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  45.53 
 
 
296 aa  201  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  47.44 
 
 
435 aa  197  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  48.51 
 
 
292 aa  196  9e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  46.96 
 
 
302 aa  193  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  47.9 
 
 
307 aa  193  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  48.05 
 
 
281 aa  193  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1689  phosphoserine phosphatase SerB  58.33 
 
 
216 aa  193  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  47.06 
 
 
400 aa  192  8e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  48.03 
 
 
299 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  47.04 
 
 
279 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11600  phosphoserine phosphatase SerB  52.48 
 
 
278 aa  191  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  47.35 
 
 
281 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1478  phosphoserine phosphatase  47.55 
 
 
215 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  46.61 
 
 
400 aa  189  8e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  45.99 
 
 
285 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  44.35 
 
 
275 aa  188  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  51.46 
 
 
279 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  41.86 
 
 
298 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  46.03 
 
 
281 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  41.86 
 
 
298 aa  186  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1969  phosphoserine phosphatase  49.74 
 
 
240 aa  186  5e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2319  phosphoserine phosphatase SerB  57.28 
 
 
213 aa  186  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  45.57 
 
 
285 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15880  phosphoserine phosphatase SerB  47.57 
 
 
225 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0152632  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  40.69 
 
 
357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  48.97 
 
 
298 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  50.49 
 
 
568 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  50.49 
 
 
454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  45.45 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  44.87 
 
 
309 aa  184  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  45.15 
 
 
310 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  50.49 
 
 
281 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  45.24 
 
 
316 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  50.49 
 
 
281 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  50.49 
 
 
281 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  45.24 
 
 
316 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  50.49 
 
 
281 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  50.49 
 
 
281 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  44.09 
 
 
289 aa  182  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  45.24 
 
 
281 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  49.27 
 
 
279 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  44.78 
 
 
291 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.426286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>