More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1168 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1168  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
213 aa  429  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.748705 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21750  phosphoserine phosphatase SerB  69.9 
 
 
234 aa  258  7e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.875318  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  63.41 
 
 
223 aa  249  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2319  phosphoserine phosphatase SerB  59.71 
 
 
213 aa  214  8e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1689  phosphoserine phosphatase SerB  58.42 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  61.86 
 
 
410 aa  209  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  53.89 
 
 
432 aa  201  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  55.12 
 
 
429 aa  201  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  54.12 
 
 
406 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2123  phosphoserine phosphatase  55.74 
 
 
297 aa  199  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0782028  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  54.23 
 
 
420 aa  199  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  50.25 
 
 
419 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  54.08 
 
 
297 aa  198  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  49.1 
 
 
403 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  54.12 
 
 
407 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  51.24 
 
 
414 aa  195  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1478  phosphoserine phosphatase  50.73 
 
 
215 aa  193  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  49.75 
 
 
306 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  49.75 
 
 
306 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  52.24 
 
 
406 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  53.65 
 
 
325 aa  191  8e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  55.14 
 
 
380 aa  191  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  52.08 
 
 
325 aa  189  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  51.23 
 
 
419 aa  189  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  51.02 
 
 
409 aa  186  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  52.6 
 
 
325 aa  186  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  49.75 
 
 
409 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  49.24 
 
 
322 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  49.24 
 
 
322 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  49.24 
 
 
322 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  49.24 
 
 
322 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  49.24 
 
 
322 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  49.24 
 
 
322 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  49.24 
 
 
322 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  49.24 
 
 
322 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0625  phosphoserine phosphatase SerB  47.32 
 
 
213 aa  181  8.000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0155366  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  48.22 
 
 
322 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  50.27 
 
 
322 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15880  phosphoserine phosphatase SerB  49.01 
 
 
225 aa  178  7e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0152632  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  49.48 
 
 
325 aa  177  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  46.73 
 
 
325 aa  175  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  51.85 
 
 
410 aa  175  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  48.77 
 
 
421 aa  175  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  48.96 
 
 
322 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  48.96 
 
 
322 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  48.96 
 
 
322 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  48.96 
 
 
322 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  48.96 
 
 
322 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  47.94 
 
 
404 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2083  phosphoserine phosphatase SerB  50.25 
 
 
419 aa  170  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726973  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  45.69 
 
 
322 aa  170  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  47.42 
 
 
429 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  44.5 
 
 
326 aa  168  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  45.88 
 
 
408 aa  168  7e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  44.5 
 
 
326 aa  167  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  44.5 
 
 
326 aa  167  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1853  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
417 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  47.8 
 
 
317 aa  166  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1834  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
417 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0739277  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1900  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
417 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11600  phosphoserine phosphatase SerB  51.63 
 
 
278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  45.88 
 
 
404 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  45.88 
 
 
429 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1969  phosphoserine phosphatase  46.46 
 
 
240 aa  164  8e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  46.39 
 
 
404 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  45.88 
 
 
415 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  45.88 
 
 
404 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  45.36 
 
 
418 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  46.43 
 
 
405 aa  162  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  44.85 
 
 
418 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  46.91 
 
 
398 aa  161  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  47.42 
 
 
302 aa  161  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  45.6 
 
 
306 aa  160  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  46.39 
 
 
412 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  44.85 
 
 
410 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  46.39 
 
 
404 aa  159  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  45.36 
 
 
410 aa  159  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0621  phosphoserine phosphatase  43.4 
 
 
220 aa  159  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  44.33 
 
 
404 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  44.33 
 
 
404 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  41.33 
 
 
398 aa  155  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  42.38 
 
 
327 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  45.36 
 
 
404 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  44.44 
 
 
332 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  45.88 
 
 
438 aa  155  6e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  45.05 
 
 
296 aa  155  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  44.67 
 
 
326 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  44.16 
 
 
326 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  42.65 
 
 
357 aa  153  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3373  phosphoserine phosphatase  42.42 
 
 
330 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.381097 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3043  phosphoserine phosphatase SerB  41.92 
 
 
335 aa  151  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0898  phosphoserine phosphatase SerB  42.49 
 
 
224 aa  152  5e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  45.88 
 
 
411 aa  150  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  43.94 
 
 
400 aa  150  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  41.84 
 
 
435 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  41.62 
 
 
328 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  44.04 
 
 
369 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  43.94 
 
 
400 aa  148  5e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  44.85 
 
 
405 aa  148  7e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  44.85 
 
 
405 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>