288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1357 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  100 
 
 
307 aa  616  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  87.32 
 
 
284 aa  497  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  71.63 
 
 
279 aa  384  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  66.9 
 
 
285 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  70.21 
 
 
279 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  65.2 
 
 
310 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  66.78 
 
 
279 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  67.49 
 
 
281 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  67.49 
 
 
454 aa  364  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  67.49 
 
 
281 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  67.49 
 
 
281 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  67.49 
 
 
281 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  67.49 
 
 
281 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  66.78 
 
 
281 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  67.49 
 
 
568 aa  361  9e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  66.2 
 
 
285 aa  355  5e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  64.44 
 
 
281 aa  349  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  63.64 
 
 
281 aa  349  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  62.24 
 
 
316 aa  349  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  63.29 
 
 
281 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  62.12 
 
 
316 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  62.12 
 
 
316 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  63.93 
 
 
281 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  49.48 
 
 
276 aa  265  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  59.91 
 
 
279 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  60.47 
 
 
235 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  59.07 
 
 
236 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  49.82 
 
 
281 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  54.31 
 
 
302 aa  250  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  57.87 
 
 
236 aa  247  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  57.08 
 
 
241 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0913  phosphoserine phosphatase SerB  53.06 
 
 
296 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.697374  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  58.49 
 
 
237 aa  242  6e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  54.17 
 
 
296 aa  239  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  55.56 
 
 
237 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  58.54 
 
 
237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  55.56 
 
 
237 aa  229  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  55.19 
 
 
264 aa  229  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  51.82 
 
 
275 aa  223  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2506  phosphoserine phosphatase SerB  56.81 
 
 
238 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3159  phosphoserine phosphatase  56.81 
 
 
238 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  45.99 
 
 
278 aa  212  7.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  44.49 
 
 
410 aa  202  8e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  48.94 
 
 
432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  47.53 
 
 
289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  50.49 
 
 
406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  43.59 
 
 
405 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  50.72 
 
 
418 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  49.03 
 
 
438 aa  194  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  48.31 
 
 
406 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  43.55 
 
 
298 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  50.23 
 
 
419 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  49.76 
 
 
418 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
412 aa  193  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  46.61 
 
 
411 aa  192  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  43.21 
 
 
298 aa  192  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  45.05 
 
 
326 aa  192  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  45.15 
 
 
398 aa  191  9e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  48.79 
 
 
404 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  49.76 
 
 
405 aa  190  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  40.59 
 
 
369 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  47.83 
 
 
410 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  43.75 
 
 
298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  46.19 
 
 
414 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  47.27 
 
 
325 aa  189  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  49.28 
 
 
404 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  45.93 
 
 
410 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  45.89 
 
 
435 aa  188  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  47.32 
 
 
326 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  47.9 
 
 
420 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  49.28 
 
 
408 aa  187  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  45.69 
 
 
357 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  48.79 
 
 
415 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  48.79 
 
 
404 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  47.27 
 
 
291 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  48.79 
 
 
405 aa  186  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  49.28 
 
 
405 aa  186  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  48.8 
 
 
411 aa  186  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  46.38 
 
 
419 aa  185  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  46.12 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  47.01 
 
 
404 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  48.65 
 
 
407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  46.58 
 
 
400 aa  183  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  47.37 
 
 
429 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  46.12 
 
 
400 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  47.32 
 
 
403 aa  182  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  48.03 
 
 
326 aa  182  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  49.15 
 
 
429 aa  182  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  47.83 
 
 
404 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  46.7 
 
 
292 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  48.03 
 
 
326 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  47.73 
 
 
291 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  48.03 
 
 
326 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  45.45 
 
 
413 aa  180  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  45.65 
 
 
280 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  46.89 
 
 
404 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  47.37 
 
 
404 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  43.55 
 
 
409 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  48.04 
 
 
404 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  44.55 
 
 
322 aa  179  7e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>