More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2846 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 237 aa  474  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  71.31 
 
 		 237 aa  347  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  70.26 
 
 		 264 aa  341  5.999999999999999e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  69.07 
 
 		 241 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  69.26 
 
 		 235 aa  331  5e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  67.67 
 
 		 236 aa  322  5e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  66.09 
 
 		 237 aa  321  7e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  70.22 
 
 		 237 aa  320  9.000000000000001e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  66.09 
 
 		 236 aa  316  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3159  phosphoserine phosphatase  69.83 
 
 		 238 aa  314  8e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2506  phosphoserine phosphatase SerB  69.83 
 
 		 238 aa  314  8e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  57.92 
 
 		 279 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  57.87 
 
 		 279 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  56.48 
 
 		 284 aa  232  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  55.56 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  55.56 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  54.17 
 
 		 454 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  54.17 
 
 		 281 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  54.17 
 
 		 281 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  54.17 
 
 		 281 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  54.17 
 
 		 281 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  54.17 
 
 		 281 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  54.17 
 
 		 568 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  54.88 
 
 		 281 aa  221  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  53.7 
 
 		 281 aa  221  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  52.94 
 
 		 281 aa  221  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  52.94 
 
 		 316 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  52.94 
 
 		 316 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  52.49 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  54.88 
 
 		 281 aa  218  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  54.88 
 
 		 316 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  54.63 
 
 		 279 aa  217  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  51.85 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  52.09 
 
 		 285 aa  209  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  52.09 
 
 		 285 aa  208  7e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  52.09 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  48.13 
 
 		 275 aa  195  5.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  45.5 
 
 		 276 aa  194  7e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  51.92 
 
 		 296 aa  191  6e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  47.22 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0913  phosphoserine phosphatase SerB  51.9 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.697374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  50.23 
 
 		 404 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  49.52 
 
 		 404 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  47.39 
 
 		 410 aa  188  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  47.39 
 
 		 278 aa  188  8e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  48.36 
 
 		 406 aa  186  3e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  50.24 
 
 		 411 aa  185  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  48.83 
 
 		 408 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  50.95 
 
 		 325 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  46.92 
 
 		 398 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  47.42 
 
 		 438 aa  182  6e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  48.36 
 
 		 410 aa  181  8.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  48.56 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  45.71 
 
 		 326 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  45.54 
 
 		 410 aa  176  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  48.1 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  49.05 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  46.48 
 
 		 412 aa  175  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  49.05 
 
 		 326 aa  175  7e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  49.05 
 
 		 326 aa  175  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  45.71 
 
 		 326 aa  174  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  45.97 
 
 		 405 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  47.14 
 
 		 325 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  46.48 
 
 		 405 aa  170  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  46.48 
 
 		 405 aa  169  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  46.67 
 
 		 325 aa  169  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  46.48 
 
 		 405 aa  169  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  46.92 
 
 		 411 aa  168  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  46.01 
 
 		 404 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  46.48 
 
 		 404 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  45.02 
 
 		 413 aa  167  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  46.19 
 
 		 325 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  46.01 
 
 		 429 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  46.3 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  45.83 
 
 		 372 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  46.8 
 
 		 322 aa  165  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  46.8 
 
 		 322 aa  165  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  46.8 
 
 		 322 aa  165  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  46.8 
 
 		 322 aa  165  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  46.8 
 
 		 322 aa  165  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  46.8 
 
 		 322 aa  165  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  46.8 
 
 		 322 aa  165  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  46.8 
 
 		 322 aa  165  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  45.81 
 
 		 322 aa  165  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  46.48 
 
 		 404 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  46.01 
 
 		 404 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  46.45 
 
 		 404 aa  164  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  46.48 
 
 		 415 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  44.6 
 
 		 429 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  46.63 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  46.45 
 
 		 419 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  45 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  46.19 
 
 		 357 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  46.31 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  46.23 
 
 		 280 aa  162  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  46.63 
 
 		 298 aa  162  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  44.55 
 
 		 418 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  44.83 
 
 		 322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  45.32 
 
 		 322 aa  161  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  45.32 
 
 		 322 aa  161  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>