More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1855 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 279 aa  559  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  94.27 
 
 		 279 aa  530  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  84.23 
 
 		 279 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  79.5 
 
 		 454 aa  454  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  79.5 
 
 		 568 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  79.5 
 
 		 281 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  79.5 
 
 		 281 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  80.94 
 
 		 281 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  79.5 
 
 		 281 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  79.5 
 
 		 281 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  79.5 
 
 		 281 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  79.5 
 
 		 316 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  79.5 
 
 		 281 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  78.78 
 
 		 281 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  78.78 
 
 		 281 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  79.14 
 
 		 316 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  79.14 
 
 		 316 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  79.14 
 
 		 281 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  70.36 
 
 		 307 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  68.9 
 
 		 284 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  63.12 
 
 		 285 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  63.12 
 
 		 310 aa  346  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  72.65 
 
 		 285 aa  344  8e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  53.41 
 
 		 276 aa  287  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  59.91 
 
 		 281 aa  274  9e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  64.19 
 
 		 235 aa  268  7e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  58.82 
 
 		 296 aa  264  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0913  phosphoserine phosphatase SerB  58.09 
 
 		 296 aa  263  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.697374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  49.82 
 
 		 302 aa  262  6e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  60.65 
 
 		 241 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  59.38 
 
 		 279 aa  261  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  64.88 
 
 		 237 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  59.72 
 
 		 236 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  60.65 
 
 		 236 aa  255  7e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  57.41 
 
 		 237 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  54.89 
 
 		 237 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  57.87 
 
 		 237 aa  232  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  54.88 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  55.98 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3159  phosphoserine phosphatase  57.41 
 
 		 238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2506  phosphoserine phosphatase SerB  57.41 
 
 		 238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  48.67 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  48.89 
 
 		 410 aa  202  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  43.49 
 
 		 405 aa  202  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  50.92 
 
 		 327 aa  202  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  49.55 
 
 		 410 aa  202  6e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  47.83 
 
 		 326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 		 412 aa  199  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  45.3 
 
 		 369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  48.65 
 
 		 438 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  47.52 
 
 		 408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  46.15 
 
 		 410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  46.8 
 
 		 432 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  47.44 
 
 		 406 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  48.31 
 
 		 406 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  47.6 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  49.1 
 
 		 405 aa  194  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  45.05 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  50.45 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  46.61 
 
 		 404 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  46.88 
 
 		 398 aa  193  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  48.29 
 
 		 419 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  48.65 
 
 		 418 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  47.5 
 
 		 404 aa  191  8e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  43.96 
 
 		 429 aa  191  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  46.4 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  48.29 
 
 		 407 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  48.65 
 
 		 405 aa  191  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  46.61 
 
 		 404 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  46.61 
 
 		 415 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  46.61 
 
 		 404 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  48.65 
 
 		 405 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  43.59 
 
 		 404 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  46.19 
 
 		 328 aa  186  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  47.04 
 
 		 420 aa  186  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  50 
 
 		 411 aa  185  8e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  45.2 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  45.2 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  45.2 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  46.67 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  45.2 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  43.22 
 
 		 404 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  45.2 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  45.2 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  45.2 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  45.2 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  46.37 
 
 		 404 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  45.5 
 
 		 322 aa  183  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  44.8 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  44.8 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  46.67 
 
 		 298 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  46.4 
 
 		 325 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  46.09 
 
 		 298 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  47.29 
 
 		 289 aa  182  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  41.76 
 
 		 429 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  45.61 
 
 		 414 aa  181  8.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  45.16 
 
 		 404 aa  182  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  47.77 
 
 		 403 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  51.49 
 
 		 372 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  46.4 
 
 		 409 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>