More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0607 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  100 
 
 		 292 aa  573  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  53.92 
 
 		 294 aa  284  9e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  55.78 
 
 		 289 aa  263  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  56.25 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  54.42 
 
 		 297 aa  256  4e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  50.5 
 
 		 297 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  49.49 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  49.83 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  53.44 
 
 		 299 aa  245  4.9999999999999997e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  52.04 
 
 		 297 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  52.31 
 
 		 295 aa  245  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  49.15 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  48.47 
 
 		 291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  53.05 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  48.31 
 
 		 291 aa  241  7e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  58.04 
 
 		 226 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  60.79 
 
 		 241 aa  241  9e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  47.14 
 
 		 296 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  47.93 
 
 		 291 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  49.66 
 
 		 292 aa  238  9e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  51.69 
 
 		 299 aa  237  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  48.62 
 
 		 291 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  47.32 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  48.85 
 
 		 296 aa  235  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  51.36 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  48.68 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  51.15 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  52.92 
 
 		 298 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  52.92 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  55.5 
 
 		 298 aa  228  6e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  49.66 
 
 		 325 aa  225  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  50.97 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  47.08 
 
 		 291 aa  223  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  49.48 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  56.58 
 
 		 298 aa  219  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  50.84 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  47.83 
 
 		 299 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  49.32 
 
 		 298 aa  195  7e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2259  phosphoserine phosphatase  49.39 
 
 		 294 aa  193  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.148184  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  47.33 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  50.75 
 
 		 281 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  47.98 
 
 		 281 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  49.75 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  46.29 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  45.81 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  49.75 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  49.75 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  49.25 
 
 		 281 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  49.25 
 
 		 316 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  44.68 
 
 		 432 aa  185  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  48.76 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  44.72 
 
 		 419 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  48.13 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  46.7 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  47.55 
 
 		 285 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  48.06 
 
 		 285 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  46.8 
 
 		 281 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  47.55 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  46.31 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  46.31 
 
 		 454 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  46.31 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  46.31 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  42.92 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  46.31 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  46.31 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  46.26 
 
 		 403 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  44.33 
 
 		 278 aa  179  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  46.19 
 
 		 284 aa  179  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  46.31 
 
 		 568 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  45.75 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  47.14 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  39.4 
 
 		 410 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  47.57 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  47.57 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  47.57 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  47.57 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  48.56 
 
 		 237 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  47.57 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  44.83 
 
 		 409 aa  176  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  49 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  47.6 
 
 		 235 aa  175  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3043  phosphoserine phosphatase SerB  45.37 
 
 		 335 aa  176  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  45 
 
 		 326 aa  175  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  48.02 
 
 		 279 aa  175  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  41.57 
 
 		 404 aa  175  8e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  41.57 
 
 		 404 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  47.03 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  47.03 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  41.73 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  47.03 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  47.03 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  45 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  47.03 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  45 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  46.26 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  45.29 
 
 		 435 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  47.03 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  47.03 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  47.03 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  42.86 
 
 		 418 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>