More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2797 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 296 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  95.25 
 
 		 296 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  79.66 
 
 		 296 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  78.57 
 
 		 295 aa  454  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  71.09 
 
 		 299 aa  431  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  70.75 
 
 		 299 aa  429  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  68.37 
 
 		 299 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  63.48 
 
 		 295 aa  368  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  60.34 
 
 		 291 aa  333  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  56.95 
 
 		 296 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  57.43 
 
 		 297 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  56.76 
 
 		 297 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  58.11 
 
 		 292 aa  315  9e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  61.2 
 
 		 299 aa  312  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  57.91 
 
 		 297 aa  311  9e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  56.76 
 
 		 291 aa  308  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  58.97 
 
 		 291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  55.36 
 
 		 291 aa  298  6e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  54.24 
 
 		 296 aa  297  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  56.64 
 
 		 291 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  56.76 
 
 		 297 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  54.88 
 
 		 298 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  56.29 
 
 		 291 aa  291  9e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  54.55 
 
 		 298 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  63.84 
 
 		 226 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  54.21 
 
 		 298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  64.35 
 
 		 241 aa  281  6.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  53.54 
 
 		 298 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  52.35 
 
 		 309 aa  279  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  54.39 
 
 		 325 aa  262  6e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  52.13 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  53.72 
 
 		 289 aa  254  9e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  48.46 
 
 		 332 aa  251  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  51.86 
 
 		 297 aa  247  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  50 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  47.14 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  44.41 
 
 		 298 aa  212  7e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  43.43 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  39.53 
 
 		 415 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  39.53 
 
 		 404 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  42.75 
 
 		 404 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  44.68 
 
 		 398 aa  186  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  43.98 
 
 		 418 aa  185  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  39.53 
 
 		 404 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  43.98 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  45.53 
 
 		 429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  49.26 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  44.26 
 
 		 404 aa  183  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  41.24 
 
 		 398 aa  182  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  43.03 
 
 		 404 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  45.11 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  44.02 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  46.98 
 
 		 404 aa  179  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  44.67 
 
 		 404 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  43.41 
 
 		 410 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  43.4 
 
 		 429 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  43.43 
 
 		 419 aa  176  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  43.35 
 
 		 411 aa  176  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  39.73 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  42.29 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  44.95 
 
 		 435 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  44.98 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  48.08 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  48.37 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  47.62 
 
 		 237 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  41.39 
 
 		 408 aa  169  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  45.54 
 
 		 281 aa  169  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  43.21 
 
 		 400 aa  169  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  42.02 
 
 		 438 aa  169  5e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  45.59 
 
 		 307 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  45.97 
 
 		 400 aa  167  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  42.36 
 
 		 432 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  40.44 
 
 		 412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  45.24 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40365  phosphoserine phosphatase activity  43.17 
 
 		 306 aa  165  6.9999999999999995e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.288179  normal  0.883376 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  42.8 
 
 		 279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  44.34 
 
 		 236 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  44.78 
 
 		 280 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  45.15 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  42.62 
 
 		 410 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1066  phosphoserine phosphatase SerB  43.14 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  43.09 
 
 		 281 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  47.12 
 
 		 237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  45.96 
 
 		 400 aa  163  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  46.57 
 
 		 285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  40.66 
 
 		 405 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  44.76 
 
 		 235 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  44.98 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  41.05 
 
 		 279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  44.1 
 
 		 411 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  42.02 
 
 		 405 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  44.62 
 
 		 276 aa  162  7e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  41.63 
 
 		 405 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0351  phosphoserine phosphatase SerB  43.14 
 
 		 213 aa  162  9e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00704526  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  41.63 
 
 		 405 aa  162  9e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  39.59 
 
 		 413 aa  160  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  47.09 
 
 		 372 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  46.08 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  41.98 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  47.09 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>